Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Recherche Clinique et Santé Publique

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

Zika virus,Description clinique,Réponse immune,Contagiosité,

Keywords

Zika virus,Clinical desciption,Immune response,Contagiousness,

Titre de thèse

Étude de l'infection à virus Zika: description clinique et biologique, étude de la réponse immunologique, et de la transmissibilité.
Zika virus infection study: clinical and biological description, immunological response description, transmissibility.

Date

Mercredi 2 Décembre 2020 à 14:00

Adresse

Université Aix Marseille Faculté des Sciences Médicales et Paramédicales : 27 bd Jean Moulin - 13385 Marseille cedex 5 Salle de thèse n°2

Jury

Directeur de these M. Jean-Baptiste MEYNARD Centre d'épidémiologie et de santé publique des armées
Rapporteur M. Denis MALVY Université Bordeaux 2
Rapporteur Mme Marie FLAMAND Institut Pasteur Paris
Examinateur M. Jean GAUDARD Université Aix Marseille
Examinateur Mme Cécile FICKO HIA Bégin
CoDirecteur de these M. Sébastien BRIOLANT Institut de recherche biomédicale des armées

Résumé de la thèse

En 2015, lors de l'émergence du virus Zika (ZIKV) en Guyane Française, plusieurs caractéristiques de l'infection étaient encore inconnues : gravité individuelle et incapacité collective, durée de prévention des transmissions vectorielle et sexuelle, démarche du diagnostic biologique. Nous avons suivi une cohorte de 49 patients ambulatoires infectés par ZIKV (RT-PCR positive dans le sang ou les urines) pendant un an (suivi continu le premier mois puis à M2, M3, M6, M9, M12). L'objectif était de décrire les caractéristiques cliniques et biologiques de l'infection aiguë et à long terme, les cinétiques de détection du virus par RT-PCR dans les liquides biologiques, et les cinétiques d'apparition et de disparition des immunoglobulines. La proportion d’asymptomatiques était moindre que décrite précédemment (27%, IC 95%, 6–61). L’incubation médiane était d’environ neuf jours. Nous avons précisé la description clinique initiale de l'infection à ZIKV, permettant notamment de mieux la discriminer des autres arboviroses (pas ou peu de fièvre, exanthème maculo-papuleux avec prurit et conjonctivite, atteinte articulaire modérée et sans ténosynovite). La moitié des patients avait une légère atteinte neurologique (aréflexie réversible). Le tableau clinique persistait en moyenne 10 jours pour l'atteinte articulaire, 13 jours pour l'exanthème et 19 jours pour l'asthénie. Au-delà du premier mois il n'y avait pas d'évolution chronique ni d'atteinte de la qualité de vie ou de la capacité à travailler. La recherche du virus dans le sang montrait une persistance plus longue dans le compartiment capillaire (médiane=5 jours, max=18) que dans le sang veineux (médiane=3, max=7). Le vecteur Aedes se gorgeant de sang capillaire, cela était en faveur d'un allongement de l'isolement vectoriel à appliquer aux patients. L’excrétion de ZIKV dans le sperme était plus courte que décrite précédemment (max=45 jours), ce qui permettait de raccourcir la durée du port du préservatif au retour de zone à risque. Les cinétiques d’excrétion virale sanguine et urinaire et la sérologie confirmaient une séquence diagnostique en trois temps : RT-PCR ZIKV dans le sang jusqu'à J5 du début des signes, urinaire jusqu'à J10, puis sérologie. Cependant la persistance des IgM, et les réactions croisées des IgG avec les autres Flavivirus entrainaient des difficultés d'interprétation de la sérologie. Une sérologie Flavivirus positive à la présentation du patient était associée à un tableau clinique Zika atténué et plus court.

Thesis resume

In 2015, during the emergence of the Zika virus (ZIKV) in French Guyana, several characteristics of the infection were still unknown: individual severity and collective incapacity, duration of prevention of vector and sexual transmission, biological diagnosis process. We followed a cohort of 49 ambulatory patients infected with ZIKV (positive RT-PCR in blood or urine) for one year (continuous follow-up the first month then at M2, M3, M6, M9, M12). The objective was to describe the clinical and biological characteristics of acute and long-term infection, the kinetics of virus detection by RT-PCR in biological fluids, and the kinetics of appearance and disappearance of immunoglobulins. The proportion of asymptomatics was lower than previously described (27%, 95% CI, 6–61). The median incubation was around nine days. We have clarified the initial clinical description of the ZIKV infection, in particular making it possible to better discriminate it from other arboviruses (no or little fever, maculopapular rash with pruritus and conjunctivitis, moderate joint involvement and without tenosynovitis). Half of the patients had mild neurological damage (reversible areflexia). The clinical picture persisted for an average of 10 days for joint involvement, 13 days for exanthema and 19 days for asthenia. Beyond the first month there was no chronic evolution or impairment of quality of life or ability to work. Testing for virus in blood showed longer persistence in the capillary compartment (median = 5 days, max = 18) than in venous blood (median = 3, max = 7). Since the Aedes vector was gorged with capillary blood, this was in favor of lengthening the vector isolation to be applied to patients. The excretion of ZIKV in semen was shorter than previously described (max = 45 days), which made it possible to shorten the duration of wearing the condom upon returning from the risk area. The blood and urine viral excretion kinetics and the serology confirmed a three-step diagnostic sequence: ZIKV RT-PCR in the blood up to D5 of the onset of signs, urine up to D10, then serology. However, the persistence of IgMs, and the cross reactions of IgGs with other Flaviviruses led to difficulties in interpreting the serology. A positive Flavivirus serology at patient presentation was associated with an attenuated and shorter Zika clinical picture.