Soutenance de thèse de CASTELLANET Olivier
Titre de thèse
Crosstalk entre cellules cancéreuses et cellules immunitaires: une approche interdisciplinaire pour découvrir les mécanismes moléculaires et concevoir des thérapies combinatoires
Crosstalk between cancer cells and immune cells: an interdisciplinary approach to uncover molecular mechanisms and design combinatorial therapies
Résumé de la thèse
La prise en charge des patientes atteintes de cancer du sein triple négatif (TNBC) demeure problématique en raison de l'absence, dans la plupart des cas, de thérapies spécifiques, ce qui crée des obstacles cliniques dus à son hétérogénéité et au manque de thérapies ciblées. Cette thèse aborde la nécessité d'améliorer les approches thérapeutiques en utilisant un modèle murin unique de TNBC (MMTV-R26Met). Ce modèle murin présente une légère surexpression de la forme sauvage du récepteur tyrosine kinase (RTK) MET dans la glande mammaire, conduisant à la formation spontanée de tumeurs qui reproduisent fidèlement les principales caractéristiques du TNBC : hétérogénéité histologique et moléculaire, infiltration de cellules immunitaires, résistance à la chimiothérapie conventionnelle et aux thérapies ciblées.
L'objectif principal de cette thèse est d'exploiter ce modèle murin pour explorer la biologie des cellules tumorales et le microenvironnement immunitaire, afin de développer et évaluer l'efficacité des thérapies combinées, telles que les traitements anticancéreux et l'immunothérapie. La phase initiale de mon projet a été dédiée à la caractérisation du modèle MMTV-R26Met et à l'identification de combinaisons de composés efficaces. Nous avons découvert une nouvelle combinaison thérapeutique ciblant la protéine anti-apoptotique BCL-XL et le régulateur du cycle cellulaire WEE1, montrant une efficacité prometteuse contre les cellules de TNBC. Nous avons ensuite étudié la spécificité du ciblage des régulateurs du cycle cellulaire combiné avec l'inhibition de BCL-XL. Nos résultats ont révélé que des niveaux élevés de BCL-XL et de régulateurs spécifiques du cycle cellulaire sont associés à un mauvais pronostic chez les patientes atteintes de TNBC. Ainsi, le ciblage de BCL-XL rend les cellules particulièrement vulnérables aux agents ciblant les kinases dépendantes des cyclines (CDKs). Cette combinaison de drogues, hautement efficace in vitro et in vivo, dérégule les signaux de survie déclenchés par les RTK, entraînant une accumulation de dommages à l'ADN et la mort par apoptose.
Conformément à notre objectif d'élucider les réseaux de signalisation sous-jacents au TNBC et à la réponse aux traitements, nous avons développé un modèle mathématique intégrant des données issues de la littérature et protéomiques expérimentales. Ce modèle peut servir d'outil précieux pour évaluer les mécanismes d'action des médicaments et identifier des vulnérabilités pouvant être ciblées par des traitements.
Dans un second temps, nous avons exploité l'immunocompétence des souris MMTV-R26Met, un modèle unique pour explorer l'interaction entre les cellules immunitaires et les cellules cancéreuses. Cette question est particulièrement pertinente dans le contexte actuel des thérapies immunitaires émergentes qui montrent des résultats cliniques prometteurs. En caractérisant les cellules tumorales et le microenvironnement immunitaire tumoral (TIM) dans le modèle MMTV-R26Met, à l'aide de la protéomique, de la cytométrie spectrale et du séquençage d'ARN à l'échelle de la cellule unique, nous avons démontré une grande hétérogénéité du TIM parmi les tumeurs TNBC spontanées, reflétant la diversité des profils immunitaires des patientes. De plus, en utilisant un modèle de greffes syngéniques que nous avons établi, nous visons à documenter in vivo l'évolution longitudinale de la signature immunitaire pendant la régression tumorale médiée par les agents anticancéreux utilisés en clinique.
En conclusion, cette thèse contribue à faire progresser notre compréhension de la biologie du TNBC et à proposer des stratégies thérapeutiques innovantes en intégrant des approches moléculaires, cellulaires et bioinformatiques. Les résultats ouvrent de nouvelles perspectives pour explorer des approches de traitement ciblé tenant compte des interactions entre les cellules tumorales et les cellules immunitaires, et offrent l'espoir d'améliorer le pronostic des patientes atteintes de TNBC.
Thesis resume
The management of patients with Triple-Negative Breast Cancer (TNBC) remains problematic due to the absence, in most cases, of specific therapies, presenting clinical obstacles because of its heterogeneity and lack of targeted therapies. This thesis addresses the need for enhanced treatment approaches by utilizing a unique TNBC mouse model (MMTV-R26Met). This mouse model bears a subtle increase in the expression level of the wild-type form of the MET receptor tyrosine kinase in the mammary gland, leading to spontaneous tumor formation that faithfully recapitulates TNBC's main characteristics: histological and molecular heterogeneity, infiltration of immune cells, resistance to conventional chemotherapy, and targeted therapies.
The primary goal of this thesis is to use this mouse model to explore tumor cells biology and the immune microenvironment, with the aim of developing and evaluating the effectiveness of combined therapies, such as anticancer treatments and immunotherapy. The initial phase of my project was focused on characterizing the MMTV-R26Met model and identifying effective drug combinations. Through a directed drug screening approach, we uncovered novel combination treatments targeting the anti-apoptotic BCL-XL and the cell cycle regulator WEE1, demonstrating promising efficacy against TNBC cells. Subsequently, we investigated the specificity of targeting cell cycle regulators in association with BCL-XL inhibition. Our findings revealed that elevated levels of BCL-XL and specific cell cycle regulators are associated with adverse TNBC patient outcomes. Therefore, targeting BCL-XL renders cells specifically vulnerable to cyclin-dependent kinase (CDK) targeting agents. This novel drug combination, highly deleterious to TNBC cell viability both in vitro and in vivo, disrupts survival signals triggered by RTKs, accompanied by DNA damage accumulation, ultimately leading to cell death through apoptosis.
In line with our objective to elucidate the signaling networks underlying TNBC and treatment response, we collaborated on developing a mathematical model integrating literature and experimental proteomic data. This mathematical model can serve as a valuable tool for assessing drug mechanisms of action and identifying vulnerabilities suitable for targeted treatment.
In a second phase, we leveraged the immunocompetence of MMTV-R26Met mice, which represent a unique model to explore the interaction between immune cells and cancer cells. This issue is particularly relevant in the current context of emerging immune-targeted therapies which are showing promising clinical results. Through the characterization of both tumor cells and the tumor immune microenvironment (TIM) in the MMTV-R26Met model using tools such as proteomics, spectral cytometry, and single-cell RNA-sequencing, we show a high TIM heterogeneity among spontaneous MMTV-R26Met TNBC tumors reflecting the diversity in the patient immune profile. Furthermore, using a syngeneic transplant model we have established, we aim to document in vivo the longitudinal evolution of the immune signature during tumor regression mediated by clinically used anticancer agents. The ultimate goal of this study is to use outcomes of our model to design and optimize combination therapies that target both tumor and immune cells.
In conclusion, this thesis contributes to advancing our understanding of TNBC biology and therapeutic strategies by integrating molecular, cellular, and bioinformatics approaches. The findings open new avenues for exploring targeted treatment approaches considering tumor-immune cell crosstalk, and hold promise to improve outcomes in TNBC patients.