Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Microbiologie

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

la diversité,structure,Bactérie magnétotactique multicellulaires,reproduction,

Keywords

diversity,structure,multicellular magnetotactic prokaryotes,reproduction,

Titre de thèse

Diversité, structure, reproduction de procaryotes multicellulaires magnétotactiques (MMP) de la mer Méditerranée
Diversity, structure, reproduction of Multicellular Magnetotactic Prokaryotes (MMPs) from the Mediterranean Sea

Date

Jeudi 26 Septembre 2019 à 14:00

Adresse

Laboratoire de chimie bactérienne (LCB) CNRS UMR 7283 Ch. Joseph Aiguier 13009, Marseille Salle Georges Morin

Jury

Directeur de these M. Long-fei WU Centre national de la recherche scientifique
CoDirecteur de these M. François ALBERTO Aix-Marseille Université
Rapporteur M. Philippe OGER Institut National des Sciences Appliquees
Rapporteur M. Carlos BLANCO Université Rennes 1
Examinateur Mme Dorothée MURAT Aix-Marseille Université
Examinateur M. Nicolas MENGUY Sorbonne Université

Résumé de la thèse

Les bactéries magnétotactiques (MTB) sont un groupe de bactéries à Gram négatif caractérisées par leur capacité à synthétiser des magnétosomes et à nager le long de lignes du champ géomagnétique. Les Procaryotes Multicellulaires Magnétotactiques (MMP) représentent les MTB les plus évoluées. Deux morphotypes de MMP ont été découverts: sphériques (sMMPs) et ellipsoïdales (eMMP). Comparé aux sMMP largement étudiés, les recherches sur les eMMP, récemment découvertes, sont limitées. Dans cette thèse, j'ai tout d'abord révélé une diversité inattendue d'eMMP de la mer Méditerranée. Quatre nouvelles espèces, ont été détectés, ce qui augmente le nombre total d'eMMP identifiés en Méditerranée de une espèce appartenant un genre à cinq espèces affiliées à deux genres. J'ai également effectué une analyse approfondie de l'architecture des eMMPs en utilisant plusieurs approches microscopiques. Les eMMP sont composés d'une couche de cellules entourant une lumière centrale, formant un globule de polarité périphérie- centre. Elles sont disposées axisymétriquement le long du grand axe des eMMP et sont radialement symétriques le long du petit axe. Leurs membranes juxtaposées relient étroitement les cellules en une entité multicellulaire. Les eMMP se reproduisent par constriction unilatérale des cellules constituantes, de la périphérie vers le centre et par fission binaire unidirectionnelle des globules ellipsoïdaux. J'ai identifié deux bactéries magnétiques Nitrospirae pour la première fois collectées, en milieu marin. Mesurant environ 5 µM, elles ont une morphologie sphérique, une motilité similaire, mais une apparence différente en microscope optiques. Elles synthétisent des magnétosomes, en forme de balle composés de magnétite et disposés en plusieurs de chaînes. Le cytoplasme des MTB Nitrospirae noir-brun contient des inclusions de soufre. Les deux nouvelles espèces de MTB Nitrospirae élargissent la distribution des MTB Nitrospirae de l’eau douce au milieu marin.

Thesis resume

Magnetotactic bacteria (MTB) are characterized by synthesizing magnetosomes and swimming along geomagnetic field lines. Multicellular Magnetotactice Prokaryotes (MMPs) is the most evolved MTB. Two morphotypes of MMPs have been discovered: spherical (sMMPs) and ellipsoidal (eMMPs). Compared with the extensively studied sMMPs, the research on recently discovered eMMPs was limited. In this thesis, I revealed a high diversity of eMMPs from the Mediterranean Sea. Four new eMMPs species have been detected, extending the total number of identified eMMPs in the Mediterranean Sea from one species of one genus to five species of two genera. I also performed a comprehensive analysis of eMMP architecture. The eMMPs was composed of one layer of cells that surround a central lumen, forming a globule with periphery-core polarity. The constituent cells are arranged axisymmetrically along the long axis of eMMPs and radial symmetric along the short axis. The juxtaposed membranes connect cells into a multicellular entity. The eMMPs reproduce through periphery–core unilateral constriction of constituent cells and unidirectional binary fission of the ellipsoidal MMPs. I have also identified two Nitrospirae MTB collected, for the first time, from marine environment. They have similar morphology, motility but different colors. They synthesized multiple bundles of bullet-shaped magnetite magnetosomes. The cytoplasm of the black-brown Nitrospirae MTB contained sulfur inclusions. The two novel Nitrospirae MTB species expand the distribution of Nitrospirae MTB from freshwater to marine.