Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Immunologie
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Paludisme,Génétique,microarray,métanalyse,
Keywords
malaria,Genetic,Microarray,metanalysis,
Titre de thèse
Compréhension des mécanismes moléculaires et des facteurs génétiques impliqués dans le paludisme sévère : analyse des profils transcriptomiques et processus biologiques caractéristiques du neuropaludisme et méta-analyse sur des gènes associés à la résistance au paludisme
Understanding molecular mechanisms and genetic factors involved in severe malaria: analysis of transcriptomic profiles and biological processes characteristic of neuropaludism and meta-analysis on genes associated with resistance agianst malaria
Date
Mercredi 19 Décembre 2018
Adresse
Université Aix-Marseille_Campus des sciences de Luminy_163 avenue de Luminy_Amphithéâtre 12_bâtiment B Amphithéâtre 12_Batiment B
Jury
| Directeur de these |
Mme Catherine NGUYEN |
Laboratoire TAGC (Theories and Approaches of Genomic Complexity) |
| Rapporteur |
Mme Florence MIGOT-NABIAS |
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| Rapporteur |
Mme Pascale COHEN |
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| CoDirecteur de these |
M. Pascal RIHET |
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| université Aix-Marseille |
Christophe BORDI |
Laboratoire LISM (Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires) |
| Examinateur |
Mme Marie-Anne DEBILY |
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Résumé de la thèse
Le paludisme est l'une des maladies infectieuses les plus dévastatrices qui a affecté environ 214 millions de personnes dans le monde et provoque la mort de près de 600 000 en 2015. Elle est causée par l'infection par le parasite plasmodium, dont P. falciparum et P. vivax sont les plus représentés. Le développement asexué du parasite dans le sang provoquent la physiopathologie de la maladie don l'évolution passe du paludisme simple au paludisme grave, notamment le neuropaludisme. Nos travaux ont d'abord porté sur l'analyse du transcriptome par microarray des cellules sanguines d'une cohorte constituée au Sénégal. L'analyse des résultats a permis d'identifier un ensemble de gène dont l'expression permettait de distinguer le profil transcriptomique du neuropaludisme de ceux du paludisme simple et des autres formes de paludisme grave. Ces gènes sont enrichies en voies biologiques impliquées dans l'activation des récepteurs des lymphocutes B et T mais des TLR et des recpteurs Fcgamma. On trouve aussi parmi ces gènes plusieurs plusieurs protéines candidates qui ont déjà été testées pour leur résistance face au paludisme, dont RNASE3 et IL1RN.
Thesis resume
Malaria is one of the most devastating infectious diseases that has affected an estimated 214 million people worldwide and caused nearly 600,000 deaths in 2015. It is caused by infection with the plasmodium parasite, P. falciparum and P. vivax are the most represented. The asexual development of the parasite in the blood causes the pathophysiology of the disease which can evolve from mild malaria to severe malaria, including cerebral malaria. Our work first focused on the analysis of the microarray transcriptome of blood cells of a cohort composed in Senegal. The analysis of the results allow to identify a set of genes whose expression permit to distinguish the transcriptomic profile of cerebral malaria from those of mild malaria and other forms of severe malaria. These genes are enriched in biological pathways involved in the activation of B and T lymphocyte receptors also TLRs and Fcgamma receptors. These genes also include several candidate proteins that have already been tested for resistance to malaria, including RNASE3 and IL1RN.
