Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Microbiologie
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
acide sinapique,Aspergillus niger,canolol,Feruloyl estérase,Neolentinus lepideus,Phenolic Acid Decarboxylase,
Keywords
Sinapic Acid,Aspergillus niger,Canolol,Feruloyl estérase,Neolentinus lepideus,Phenolic Acid Decarboxylase,
Titre de thèse
Exploration du répertoire enzymatique fongique pour la synthèse de vinylphénols à partir dacides p-hydroxycinnamiques biosourcés.
Exploration of the fungal enzymatic repertoire for the synthesis of vinylphenols from biosourced p-hydroxycinnamic acids.
Date
Vendredi 14 Juin 2024 à 14:00
Adresse
Polytech Marseille Luminy
Bat A
163 avenue de Luminy
13009 Marseille Salle de documentation A
Jury
Directeur de these |
Mme Anne LOMASCOLO |
Aix Marseille Université |
Rapporteur |
Mme Carole MOLINA-JOUVE |
INSA Toulouse |
Rapporteur |
Mme Catherine VIROT HUMEAU |
Université de Lorraine |
Examinateur |
M. Laurent ROSSO |
Terres Inovia |
Examinateur |
M. Pedro COUTINHO |
Aix Marseille Université |
Président |
M. Jean-Louis MEGE |
Aix Marseille Université |
Résumé de la thèse
Les vinylphénols, tels que le canolol (2,6-diméthoxy-4-vinylphénol), qui présentent une activité antioxydante, sont réputés bioactifs (anti-carcinogènes, anti-inflammatoires) et constituent des molécules plateformes en chimie verte (précurseurs de biopolymères). Ils peuvent être obtenus par décarboxylation non-oxydative des acides p-hydroxycinnamiques correspondants, tels que lacide sinapique (acide 4-hydroxy-3,5-diméthoxycinnamique) dans le cas du canolol. Ces acides p-hydroxycinnamiques se retrouvent dans des biomasses végétales résiduelles, abondantes, renouvelables et peu onéreuses, comme les tourteaux de colza et de tournesol qui sont les co-produits solides issus du pressage et de la trituration des graines pour lobtention dhuile. Dans ce travail, ont été exploités les capacités métaboliques et le répertoire enzymatique complémentaire des champignons filamenteux ascomycètes et basidiomycètes, plus particulièrement les enzymes de type féruloyl estérases (FAE) et Phenolic Acid Decarboxylases (PAD) pour développer un procédé biotechnologique de synthèse de vinylphénols à partir des tourteaux. Nous avons mis en exergue la capacité des enzymes AnFAEA, AnFAEB et ChloE issues de souches dAspergillus niger pour la libération dacides p-hydroxycinnamiques tels que lacide sinapique ou lacide caféique, à partir des formes estérifiées présentes dans les tourteaux. Par ailleurs, il a été montré, pour la première fois, que lespèce basidiomycète Neolentinus lepideus est la seule capable de biotransformer, en milieu de culture liquide, lacide sinapique en canolol avec des taux atteignant 1-1,5 g/L et un rendement molaire de 70-80%. Lespèce N. lepideus sest donc révélée posséder une activité PAD bien particulière, capable de décarboxyler lAS de manière native. Par la suite, la PAD native intracellulaire (appelée NlePAD) de la souche N. lepideus BRFM15 a été purifiée et caractérisée. Une analyse protéomique a mis en évidence lexistence dune seule séquence protéique de type PAD dans le protéome intracellulaire de la souche. Lenzyme NlePAD est une PAD versatile, stable et, à ce jour, il sagit de la seule PAD native microbienne capable de catalyser efficacement la synthèse de canolol à partir dacide sinapique. Mise en uvre in vitro, la NlePAD a permis la synthèse de 1,9 à 3,8 mg de canolol par gramme de tourteau de colza initial.
Thesis resume
Vinylphenols, such as canolol (2,6-dimethoxy-4-vinylphenol), which exhibit antioxidant activity, are described to be bioactive (anti-carcinogenic, anti-inflammatory) compounds, and constitute platform molecules in green chemistry (precursors of biopolymers). They can be obtained by non-oxidative decarboxylation of the corresponding p-hydroxycinnamic acids, such as sinapic acid (4-hydroxy-3,5-dimethoxycinnamic acid) in the case of canolol. These p-hydroxycinnamic acids can be found in residual plant biomasses, which are abundant, renewable, and inexpensive feedstocks, such as rapeseed and sunflower meals, the solid co-products from the pressing and crushing of seeds to obtain oil. In this work, the metabolic capacities and the complementary enzymatic repertoire of ascomycete and basidiomycete filamentous fungi were exploited, more particularly feruloyl esterase (FAE) and phenolic acid decarboxylase (PAD) enzymes, to develop a biotechnological process for the synthesis of vinylphenols from oilseed meals. We highlighted the capacity of the enzymes AnFAEA, AnFAEB and ChloE from strains of Aspergillus niger for the release of p-hydroxycinnamic acids, such as sinapic acid or caffeic acid, from the esterified forms found in the meals. Furthermore, for the first time, the basidiomycete species Neolentinus lepideus was highlighted as the sole species capable of biotransforming, in liquid culture medium, sinapic acid into canolol with levels reaching 1-1.5 g/L and a molar yield of 70-80%. The species N. lepideus was therefore shown to possess a very specific PAD activity, capable of decarboxylating sinapic acid natively. Consequently, the native intracellular PAD (called NlePAD) from the N. lepideus BRFM15 strain was purified and characterized. A proteomic analysis showed the existence of a single PAD-type protein sequence in the intracellular proteome of the strain. The NlePAD enzyme is a versatile and stable PAD, and to date, this is the only microbial native PAD capable of efficiently catalyzing the synthesis of canolol from sinapic acid. Implemented in vitro, NlePAD allowed the synthesis of 1.9 to 3.8 mg of canolol per gram of initial rapeseed meal.