Soutenance de thèse de Ndiaw GOUMBALLA

Le Grand Magal de Touba (GMT) se déroule chaque année au Sénégal regroupant 4-5 millions de pèlerins. Les infections semblent fréquentes chez les pèlerins malades pendant leur séjour à Touba. 1) surveillance syndromiques dans les structures sanitaires de la région médicale de Diourbel durant le GMT de 2016. Les registres de consultations documentés par les soignants ont été analysés. Sur 20850 patients, les symptômes les plus fréquents étaient les céphalées (28%), les symptômes d’infection gastro-intestinale (22%,), la fièvre sans origine connue (17%), les symptômes d’infection respiratoire (17%), le paludisme documenté par test diagnostique rapide (3%). 2) surveillance des infections chez les pèlerins de Dielmo et Ndiop participant au GMT de 2017-2021. Les pèlerins et des villageois contrôles ne participant pas au GMT ont été soumis à un questionnaire clinique, démographiques et d’adhérence aux mesures de prévention et de thérapeutique. Des prélèvements microbiologiques respiratoires et digestifs ont été systématiquement réalisés avant et après le GMT pour recherche de pathogènes par PCR. L’étude a inclus 533 pèlerins. L’âge moyen était de 24 ans et 51% étaient des hommes. 55% et 13% ont rapporté des symptômes respiratoires et gastro-intestinaux. 18% ont acquis un virus respiratoire, notamment le rhinovirus (10%) et les coronavirus endémiques (6%) et 40% une bactérie, notamment Haemophilus influenzae (19%) et Streptococcus pneumoniae (14%). 19% et 11% ont acquis Escherichia coli Enteroaggrégatif et E. coli Enteropathogénique. En 2019 les symptômes étaient plus élevé chez les pèlerins (60%) que chez les contrôles (8%) et l’acquisition de rhinovirus, de coronavirus endémiques, de S. pneumoniae et de Moraxella catarrhalis étaient de 22%, 7%, 17% et 7% vs. 4%, 0%, 5% et 1% chez les contrôles. L'utilisation fréquente du masque et du savon pour les mains étaient fréquente en 2020-2021 (28% et 94%). Moins de 2% des pèlerins ont reçu des antibiotiques. Une diminution de l’acquisition de pathogènes a été observée en 2020-2021. Les symptômes respiratoires étaient associés avec l’acquisition de virus et de S. pneumoniae. Le lavage des mains était associé à une diminution de l’acquisition de rhinovirus et de coronavirus endémiques. Le port du masque était associé à une diminution des symptômes respiratoires. 3) investigation microbiologique des patients ayant consulté au centre de santé de Mbacké durant le GMT de 2018 à 2021 pour des symptômes d’infection. Les patients présentant une toux, une diarrhée ou une fièvre isolée ont été inclus. Les pathogènes respiratoires, gastro-intestinaux et sanguins ont été testé par PCR. 538 patients ont été inclus. Au total 46% étaient des femmes et l’âge moyen était de 17 ans. Sur 326 échantillons collectés chez les patients qui avaient de la toux, 63% étaient positifs à un virus respiratoire et 33% virus de la grippe. Un taux élevé de bactéries a été observé pour H. influenzae (73%), S. pneumoniae (51%) et M. catarrhalis (46.0%). Sur 95 échantillons collectés chez les patients avec de la diarrhée, 71% étaient positifs avec un taux élevé de bactéries de 4% pour Tropheryma whipplei à 45% pour E. coli Enteropathogénique. Sur 141 prélèvements sanguins collectés chez les patients fébriles, 32% étaient positifs incluant Plasmodium falciparum (21%), Borrelia sp. (6%) et le virus de la dengue (5%). En conclusion, les infections respiratoires, digestives et les fièvres isolées sont fréquentes au cours du GMT et les pathogènes responsables ont été identifiés. Certaines mesures préventives ont prouvé leur efficacité comme le lavage des mains et le port du masque. La vaccination contre le pneumocoque et le virus de la grippe sont à envisager. L’utilisation de la PCR diagnostique pourrait guider la thérapeutique de ces infections.

The Grand Magal of Touba (GMT) takes place each year in the holy city of Touba in Senegal. An estimated 4 to 5 million pilgrims to participate each year. Infections were common among pilgrims during their stay in Touba. In this work we developed three parts: 1) Syndromic surveillance among ill pilgrims during the 2016 Grand Magal in Diourbel medical region structures. The consultation registers documented by the medical staff were analyzed. Out of 20850 patients, the most frequent symptoms were headache (28.4%), symptoms of gastrointestinal infection (22.0%), fever of known origin (17.2%), symptoms of respiratory infection (17.1%), malaria documented by rapid diagnostic test (3.0%). 2) Surveillance of infections among pilgrims in the villages of Dielmo and Ndiop participating at the GMT from 2017 to 2021. Pilgrims and controls villagers who not participating in the GMT were surveyed for clinical, demographic, and adherence of preventive measures. Respiratory and digestive samples were collected systematically before and after the GMT for pathogen detection by PCR. The study included 533 pilgrims. The mean age was 24 years and 50.5% were male. 55% and 13% reported respiratory and gastrointestinal symptoms. 18% acquired a respiratory virus, including rhinovirus (10%) and endemic coronaviruses (6%) and 40% acquired a bacteria, including Haemophilus influenzae (19%) and Streptococcus pneumoniae (14%). 19% and 11% acquired Enteroaggregative Escherichia coli and Enteropathogenic E. coli. In 2019 the study showed that symptoms were significantly higher in pilgrims (60%) than in controls (8%) and the acquisition of rhinovirus, endemic coronavirus, S. pneumoniae and Moraxella catarrhalis were 22%, 7%, 17% and 7% vs 4%, 0%, 5% and 1% in controls. The frequent use of face masks and hand soap was frequent in 2020–2021 (28% and 94%). Less than 2% of pilgrims received antibiotics. Respiratory symptoms were associated with virus and S. pneumoniae acquisition. Using hand soap was associated with a decrease in the acquisition of rhinovirus and coronavirus. Using face masks was associated with a decrease in reporting of respiratory symptoms. 3) Microbiological investigation of patients who consulted at the Mbacké health center during the GMT from 2018 to 2021 for symptoms of infection. Patients presenting with cough, diarrhea, or isolated fever were included. Respiratory, gastrointestinal, and blood borne pathogens were tested by PCR. 538 patients were included. A total 46% were female and the mean age was 17 years. Of 326 samples collected from patients with cough, 63% were positive for respiratory viruses and 33% influenza viruses. A high rate of bacteria was observed for Haemophilus influenzae (73%), S. pneumoniae (51%) and M. catarrhalis (46%). Out of 95 samples collected from patients with diarrhea, 71% were positive with a high level of bacteria ranging from 4% for Tropheryma whipplei to 45% for Enteropathogenic E. coli. Of 141 blood samples collected from febrile patients, 32% were positive including Plasmodium falciparum (21%), Borrelia sp. (6%) and dengue virus (5%). In conclusion, respiratory and digestive infections and isolated fevers were frequent during GMT and the responsible pathogens have been identified. Some preventive measures have proven to be effective, such as hand washing and wearing a mask. Vaccination against pneumococcus and influenza virus should be considered. The use of diagnostic PCR could guide the treatment of these infections.