enseignant-chercheur, enseignant du supérieur*chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*

Coordonnées

Doctorat

Intitulé : Biologie-Santé - Spécialité Bioinformatique et Génomique
1ère inscription en thèse : Octobre 2016
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Date de soutenance de la thèse : 19 Décembre 2019
Sujet : Etude des éléments cis-régulateurs : identification et caractérisation
Directeur de thèse : Christine BRUN
Co-directeur : BENOIT BALLESTER
Unité de recherche : TAGC - Theories and Approaches of Genomic Complexity
Intitulé de l'équipe :

Master

Intitulé : BBSG
Décembre 2015 - AMU
Mention : Bien

Langues vivantes

Anglais : C1 - Avancé
Français : Maternel

Production scientifique

  • ReMap 2018: An updated regulatory regions atlas from an integrative analysis of DNA-binding ChIP-seq experiments.
    Nucleic Acids Research 2017
    Jeanne Chèneby Marius Gheorghe Marie Artufel Anthony Mathelier Benoit Ballester
    https://doi.org/10.1093/nar/gkx1092
  • JASPAR 2018: update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework.
    Nucleic Acids Research 2017
    Aziz Khan Oriol Fornes Arnaud Stigliani Marius Gheorghe Jaime A Castro-Mondragon Robin van der Lee Adrien Bessy Jeanne Chèneby Shubhada R Kulkarni Ge Tan Damir Baranasic David J Arenillas Albin Sandelin Klaas Vandepoele Boris Lenhard Benoît Ballester Wyeth W Wasserman François Parcy Anthony Mathelier
    https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx1126
  • A map of direct TF–DNA interactions in the human genome
    Nucleic Acids Research 2018
    Marius Gheorghe, Geir Kjetil Sandve, Aziz Khan, Jeanne Chèneby, Benoit Ballester, Anthony Mathelier
    https://doi.org/10.1093/nar/gky1210
  • ReMap 2020: A database of regulatory regions from an integrative analysis of Human and Arabidopsis DNA-binding sequencing experiments
    Nucleic Acids Research 2019
    Jeanne Chèneby, Zacharie Ménétrier, Martin Mestdagh, Thomas Rosnet, Allyssa Douida, Wassim Rhalloussi, Aurélie Bergon, Fabrice Lopez, Benoit Ballester
  • JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor binding profiles
    Nucleic Acids Research 2019
    Oriol Fornes1, Jaime A. Castro-Mondragon, Aziz Khan, Robin van der Lee1, Xi Zhang1, Phillip A. Richmond, Bhavi P. Modi, Solenne Correard, Marius Gheorghe, Damir Baranašić, Ge Tan, Jeanne Chèneby, Benoît Ballester, Albin Sandelin, Boris Lehnard, Wyeth W. Wasserman, and Anthony Mathelier