Monsieur Cédric ABAT / Docteur


Epidemiologiste en santé publique

Coordonnées

Emplois

Informations complémentaires : - sports : karaté (deux ans, ceinture orange) et jujitsu (deux ans, ceinture verte), football et rugby. - voyages.

Recherche : NON

Compétences

- Pack Office (version 2007) et Open Office.org 3 - R, phpMyAdmin, Exao, Mapple (modélisation et statistiques), Arcgis (cartographie). - 2009: C2I – Université des sciences de Perpignan Via Domitia (UPVD).

Techniques maîtrisées

- Analyse de données biologiques (biostatistique). - Gestion de bases de données. - Création de systèmes de surveillance sur Excel par l'utilisation du langage visual basic.

Doctorat

Titre : Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses

1ère inscription en thèse : 29 octobre 2012 / 3A

Ecole doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé

Date de soutenance de thèse : 12 octobre 2015

Sujet : DÉVELOPPEMENT DE NOUVEAUX OUTILS INFORMATIQUES DE SURVEILLANCE EN TEMPS RÉEL DES PHÉNOMÈNES ANORMAUX BASÉS SUR LES DONNÉES DE MICROBIOLOGIE CLINIQUE DU LABORATOIRE DE LA TIMONE

Directeur de thèse : ROLAIN Jean-Marc

Co-directeur : COLSON Philippe

Unité de recherche : URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales

Equipe : Unité des Rickettsies et des pathogènes émergents

Master

Titre : Ecologie-Biodiversité

septembre 2012 - Université Montpellier II

Mention : bien

Production scientifique

  • Identification of Rare Pathogenic Bacteria in a Clinical Microbiology Laboratory: Impact of Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight Mass Spectrometry
    J Clin Microbiol, 2013
    Piseth Seng, Cédric Abat, Jean Marc Rolain, Philippe Colson, Jean-Christophe Lagier, Frédérique Gouriet, Pierre Edouard Fournier, Michel Drancourt, Bernard La Scola and Didier Raoult
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3697718/
  • Increasing Trend of Invasive Group B Streptococcal Infections, Marseille, France
    Clinical Infectious Disease, 2013
    Cédric Abat, Hervé Chaudet, Didier Raoult, and Philippe Colson
    http://cid.oxfordjournals.org/content/early/2013/12/13/cid.cit777
  • Salmonella and Campylobacter Contamination of Ready-to-Eat Street-Vended Pork Meat Dishes in Antananarivo, Madagascar: A Risk for the Consumers?
    Foodborne Pathog Dis, 2015
    Cardinale E, Abat C, Bénédicte C, Vincent P, Michel R, Muriel M
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25764444
  • Increasing burden of urinary tract infections due to intrinsic colistin-resistant bacteria in hospitals in Marseille, France.
    Int J Antimicrob Agents, 2015
    Abat C, Desboves G, Olaitan AO, Chaudet H, Roattino N, Fournier PE, Colson P, Raoult D, Rolain JM
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25497970
  • Correlation between sputum and bronchoalveolar lavage fluid cultures
    J Clin Microbiol, 2015
    Dubourg G, Abat C, Rolain JM, Raoult D
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25540405
  • Worldwide decrease in methicillin-resistant Staphylococcus aureus: do we understand something?
    Clin Microbiol Infect, 2015
    Rolain JM, Abat C, Brouqui P, Raoult D
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25941171
  • Emergence of clusters of CRF02_AG and B human immunodeficiency viral strains among men having sex with men exhibiting HIV primary infection in southeastern France
    J Med Virol., 2015
    Tamalet C, Ravaux I, Moreau J, Brégigeon S, Tourres C, Richet H, Abat C, Colson P
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25873310
  • A real-time microbiology laboratory surveillance system implemented for the detection of abnormal events and emerging infections, Marseille, France
    Emerg Infect Dis, 2015
    Cédric Abat, Hervé Chaudet, Philippe Colson, Jean-Marc Rolain, Didier Raoult

  • E.cecorum human infection, France
    NMNI, 2015
    Edouard Delaunay; Cédric Abat; Jean-Marc Rolain

  • Dramatic decrease of Streptococcus pneumoniae in Marseille, 2009-2014
    EJCMID, 2015
    Cédric ABAT, Didier RAOULT, Jean-Marc ROLAIN

  • Low level of resistance in Enterococci strains isolated in four French hospitals, Marseille, France
    MDR, 2015
    Cédric ABAT, Didier RAOULT, Jean-Marc ROLAIN

  • Molecular epidemiology and distribution of serotypes, genotypes, and antibiotic resistance genes of Streptococcus agalactiae clinical isolates from Guelma, Algeria, and Marseille, France
    EJCMID, 2015
    Amira Bergal, Lotfi Loucif, Djamel Eddine Benouareth, Ahmed Aimen Bentorki, Cédric Abat and Jean-Marc Rolain

  • EPIMIC: a simple homemade computer program for real-time EPIdemiological surveillance and alert based on MICrobiological data
    PlosOne, 2015
    P. COLSON, JM ROLAIN, C ABAT, R. CHARREL, PE FOURNIER, D. RAOULT

  • Citrobacter amalonaticus urinary-tract human infections, Marseille, France
    Journal of Clinical Microbiology, 2015
    V. GARCIA, C. ABAT and JM. ROLAIN

  • Traditional and syndromic surveillance of infectious diseases and pathogens
    Eurosurveillance, 2015
    C. Abat, H. Chaudet, JM. Rolain, P. Colson, D. Raoult

Langues

Anglais : C2 - Courant

Espagnol : B1 - Intermédiaire

Malgache : A2 - Élémentaire