Ecole Doctorale

Sciences de l'Environnement

Spécialité

Sciences de l'environnement : Anthropologie biologique

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

Paléopathologie,Anthropologie biologique,archéologie préventive,,

Keywords

Paleopathology,Biological anthropology,Commercial archaeology,,

Titre de thèse

Profils paléopathologiques et Archéologie préventive : Apports d'un outil original et application à des ensembles diachroniques
Paleopathological profiles and commercial archaeology : contributions of an original tool and application to diachronic series

Date

Mardi 24 Novembre 2020 à 14:00

Adresse

Faculté des Sciences Médicales et Para-médicales de la Timone, 27 Boulevard Jean Moulin, 13385, Marseille Salle de visioconférence, université de médecine Timone

Jury

Directeur de these Mme Aurore SCHMITT Aix-Marseille université, UMR 7268 ADES
CoDirecteur de these M. Yann ARDAGNA Aix-Marseille
Examinateur M. Sacha KACKI Université de Bordeaux, UMR 5199 PACEA
Examinateur Mme Kathia CHAUMOITRE Université d'Aix-Marseille, UMR 7268 ADES ; AP-HM
Rapporteur M. Bruno MAUREILLE Université de Bordeaux, UMR 5199 PACEA
Rapporteur M. Norbert TELMON Université Toulouse 3, UMR 5288 AMIS

Résumé de la thèse

L’archéologie préventive, par la fouille de nombreux ensembles funéraires, génère un nombre conséquent de collections ostéologiques, élargissant ainsi le potentiel et les perspectives de recherche dans le domaine de la paléopathologie. Toutefois, les contraintes d’intervention, tant économiques que temporelles, ainsi qu’un manque de spécialistes, conduisent le plus souvent à ne mettre en place qu’une approche paléobiologique des séries ostéoarchéologiques (détermination du sexe, de l’âge et des pathologies les plus évidentes). La description exhaustive des lésions demeure extrêmement rare et le potentiel d’informations paléopathologiques est à peine exploré. A ce contexte préventif fortement contraignant pour l’approche paléopathologique, il faut ajouter l’absence d’outils adaptés permettant d’obtenir des données pertinentes dans les délais impartis ou, au moins, d’évaluer le potentiel d’étude et l’intérêt scientifique d’une série ostéoarchéologique. Afin de concilier paléopathologie et archéologie préventive, un des aspects de ce travail a consisté au développement d’un outil de base de données. Ce dernier a pour objectif l’enregistrement de tous les caractères osseux ayant un intérêt interprétatif dans l’établissement du profil pathologique d’une série. Cette étape nécessitait de s’appuyer sur une revue exhaustive de la littérature paléopathologique classique mais aussi de proposer des protocoles d’enregistrement originaux de certaines lésions complexes et posant encore des problèmes interprétatifs, telles que les réactions périostées. Aux termes de ces réflexions, l’outil informatique comporte trois degrés d’enregistrement, « maximal, intermédiaire et simplifié », partageant une base fondamentale commune, permettant de prendre en compte aussi bien les contraintes du cadre d’intervention archéologique que le profil de l’utilisateur potentiel, lequel peut ne pas avoir été spécifiquement formé à la paléopathologie et au diagnostic rétrospectif. Au-delà de la caractérisation fondamentale, qui reprend les données essentielles à toute étude sur restes ostéoarchéologiques (représentation osseuse et conservation corticale, recrutement), cet outil permet ainsi, aux termes d’une étude post-fouille, de caractériser une série de manière plus ou moins détaillée en fonction du protocole d’enregistrement : caractérisation nosologique, diagnostique et lésionnelle, dans le cadre de l’enregistrement maximal ou nosologique et diagnostique, via l’enregistrement intermédiaire. Le système d’enregistrement simplifié, basé sur un profil d’anomalies osseuses, propose quant à lui une caractérisation ostéobiographique visant à mettre en avant le potentiel d’étude paléopathologique en prévision d’autres analyses. Le fonctionnement standardisé et automatisé de l’outil aide et facilite l’enregistrement, tout en réduisant le temps nécessaire au traitement, à l’archivage et à l’exploitation des données. Il optimise également la réponse aux obligations légales incombant à l’archéologie préventive, aux premiers rangs desquelles figure le rendu d’un rapport de fouille, grâce à la disponibilité immédiate, aux termes de l’étude, de résultats fiables et modulables selon différents critères (âge, sexe, chronologie, etc.). Le test de l’outil, via l’application du protocole d’enregistrement maximal et simplifié à 231 squelettes provenant de quatre séries ostéoarchéologiques, a confirmé que ce celui-ci est applicable dans les délais généralement dédiés à une étude anthropologique dans le cadre de l’archéologie préventive. En outre, les résultats générés par l’exploitation automatisée ont démontré son efficacité et sa portée pour établir le profil paléopathologique ou ostéobiographique d’une série et ce, notamment, à travers l’atténuation ou le contournement de biais théoriques et méthodologiques majeurs via l’application aux données de filtres multicritères.

Thesis resume

Commercial archaeology, through the excavation of numerous funerary contexts, provides many osteological series, expanding the potentiality and new issues for research in the field of paleopathology. However, intervention constraints, both economic and temporal, as well as a lack of specialists, lead frequently to a basic biological approach of the osteoarchaeological series (assessment of sex, age, and most obvious pathologies). The exhaustive description of lesions remains extremely rare and the paleopathological characterisation is hardly explored. Besides, a suitable tool allowing relevant data within the allotted timeframe or, at least, the study of the scientific interest of an osteoarchaeological series is missing. In order to conciliate palaeopathology and commercial archaeology, one aspect of this work consisted in the development of a database tool. Its main objective was to record all the bone characters having an interpretative interest in the establishment of the pathological profile of a series. This step required to rely on an exhaustive review of classical paleopathological literature but also to propose original recording protocols for some complex paleopathological lesions and still problematic interpretation, such as periosteal reactions. According to these considerations, the informatic tool is composed of three degrees of recording, "maximum, intermediate and simplified", sharing a common fundamental basis, making possible to take into account both the pressure of the archaeological framework and the profile of the potential user, who may not have been specifically trained in paleopathology and retrospective diagnosis. Beyond the fundamental characterization, which includes the basic data necessary for the study of osteoarchaeological remains (bone preservation and cortical conservation, recruitment,), the tool enables, at the end of a post-excavation study, to characterize a series in a more or less detailed manner, depending on the registration protocol : nosological, diagnostic and lesional characterization, as part of maximum registration or nosological and diagnostic, through intermediate registration. The simplified recording system, based on a profile of bone abnormalities, offers an osteobiographical characterization and aimed highlighting the potentiality for paleopathological studies. The standardized and automated running of the tool helps and facilitates recording, while reducing the time required for process, archive, and exploited data. It also optimizes the response to legal obligations specific to commercial archaeology, the first of which is the production of a report, by the immediate availability of reliable and flexible results according to different criteria (age, sex, chronology, etc.). The tool was tested, through the application of the maximum and simplified recording protocol, to 231 skeletons from four osteoarchaeological series and support its applicability within the time allowed generally to an anthropological study in the context of commercial archaeology. In addition, the results generated by automated exploitation have demonstrated its effectiveness and its scope for establishing the paleopathological or osteobiographical profile of a series, particularly through the attenuation or circumvention of major theoretical and methodological biases by multicriteria filters applied to the data.