Ecole Doctorale
Sciences de l'Environnement
Spécialité
Sciences de l'environnement : Anthropologie biologique
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Paléopathologie,Anthropologie biologique,archéologie préventive,,
Keywords
Paleopathology,Biological anthropology,Commercial archaeology,,
Titre de thèse
Profils paléopathologiques et Archéologie préventive : Apports d'un outil original et application à des ensembles diachroniques
Paleopathological profiles and commercial archaeology : contributions of an original tool and application to diachronic series
Date
Tuesday 24 November 2020 à 14:00
Adresse
Faculté des Sciences Médicales et Para-médicales de la Timone, 27 Boulevard Jean Moulin, 13385, Marseille Salle de visioconférence, université de médecine Timone
Jury
Directeur de these |
Mme Aurore SCHMITT |
Aix-Marseille université, UMR 7268 ADES |
CoDirecteur de these |
M. Yann ARDAGNA |
Aix-Marseille |
Examinateur |
M. Sacha KACKI |
Université de Bordeaux, UMR 5199 PACEA |
Examinateur |
Mme Kathia CHAUMOITRE |
Université d'Aix-Marseille, UMR 7268 ADES ; AP-HM |
Rapporteur |
M. Bruno MAUREILLE |
Université de Bordeaux, UMR 5199 PACEA |
Rapporteur |
M. Norbert TELMON |
Université Toulouse 3, UMR 5288 AMIS |
Résumé de la thèse
Larchéologie préventive, par la fouille de nombreux ensembles funéraires, génère un nombre conséquent de collections ostéologiques, élargissant ainsi le potentiel et les perspectives de recherche dans le domaine de la paléopathologie. Toutefois, les contraintes dintervention, tant économiques que temporelles, ainsi quun manque de spécialistes, conduisent le plus souvent à ne mettre en place quune approche paléobiologique des séries ostéoarchéologiques (détermination du sexe, de lâge et des pathologies les plus évidentes). La description exhaustive des lésions demeure extrêmement rare et le potentiel dinformations paléopathologiques est à peine exploré. A ce contexte préventif fortement contraignant pour lapproche paléopathologique, il faut ajouter labsence doutils adaptés permettant dobtenir des données pertinentes dans les délais impartis ou, au moins, dévaluer le potentiel détude et lintérêt scientifique dune série ostéoarchéologique.
Afin de concilier paléopathologie et archéologie préventive, un des aspects de ce travail a consisté au développement dun outil de base de données. Ce dernier a pour objectif lenregistrement de tous les caractères osseux ayant un intérêt interprétatif dans létablissement du profil pathologique dune série. Cette étape nécessitait de sappuyer sur une revue exhaustive de la littérature paléopathologique classique mais aussi de proposer des protocoles denregistrement originaux de certaines lésions complexes et posant encore des problèmes interprétatifs, telles que les réactions périostées.
Aux termes de ces réflexions, loutil informatique comporte trois degrés denregistrement, « maximal, intermédiaire et simplifié », partageant une base fondamentale commune, permettant de prendre en compte aussi bien les contraintes du cadre dintervention archéologique que le profil de lutilisateur potentiel, lequel peut ne pas avoir été spécifiquement formé à la paléopathologie et au diagnostic rétrospectif. Au-delà de la caractérisation fondamentale, qui reprend les données essentielles à toute étude sur restes ostéoarchéologiques (représentation osseuse et conservation corticale, recrutement), cet outil permet ainsi, aux termes dune étude post-fouille, de caractériser une série de manière plus ou moins détaillée en fonction du protocole denregistrement : caractérisation nosologique, diagnostique et lésionnelle, dans le cadre de lenregistrement maximal ou nosologique et diagnostique, via lenregistrement intermédiaire. Le système denregistrement simplifié, basé sur un profil danomalies osseuses, propose quant à lui une caractérisation ostéobiographique visant à mettre en avant le potentiel détude paléopathologique en prévision dautres analyses.
Le fonctionnement standardisé et automatisé de loutil aide et facilite lenregistrement, tout en réduisant le temps nécessaire au traitement, à larchivage et à lexploitation des données. Il optimise également la réponse aux obligations légales incombant à larchéologie préventive, aux premiers rangs desquelles figure le rendu dun rapport de fouille, grâce à la disponibilité immédiate, aux termes de létude, de résultats fiables et modulables selon différents critères (âge, sexe, chronologie, etc.).
Le test de loutil, via lapplication du protocole denregistrement maximal et simplifié à 231 squelettes provenant de quatre séries ostéoarchéologiques, a confirmé que ce celui-ci est applicable dans les délais généralement dédiés à une étude anthropologique dans le cadre de larchéologie préventive. En outre, les résultats générés par lexploitation automatisée ont démontré son efficacité et sa portée pour établir le profil paléopathologique ou ostéobiographique dune série et ce, notamment, à travers latténuation ou le contournement de biais théoriques et méthodologiques majeurs via lapplication aux données de filtres multicritères.
Thesis resume
Commercial archaeology, through the excavation of numerous funerary contexts, provides many osteological series, expanding the potentiality and new issues for research in the field of paleopathology. However, intervention constraints, both economic and temporal, as well as a lack of specialists, lead frequently to a basic biological approach of the osteoarchaeological series (assessment of sex, age, and most obvious pathologies). The exhaustive description of lesions remains extremely rare and the paleopathological characterisation is hardly explored. Besides, a suitable tool allowing relevant data within the allotted timeframe or, at least, the study of the scientific interest of an osteoarchaeological series is missing.
In order to conciliate palaeopathology and commercial archaeology, one aspect of this work consisted in the development of a database tool. Its main objective was to record all the bone characters having an interpretative interest in the establishment of the pathological profile of a series. This step required to rely on an exhaustive review of classical paleopathological literature but also to propose original recording protocols for some complex paleopathological lesions and still problematic interpretation, such as periosteal reactions.
According to these considerations, the informatic tool is composed of three degrees of recording, "maximum, intermediate and simplified", sharing a common fundamental basis, making possible to take into account both the pressure of the archaeological framework and the profile of the potential user, who may not have been specifically trained in paleopathology and retrospective diagnosis. Beyond the fundamental characterization, which includes the basic data necessary for the study of osteoarchaeological remains (bone preservation and cortical conservation, recruitment,), the tool enables, at the end of a post-excavation study, to characterize a series in a more or less detailed manner, depending on the registration protocol : nosological, diagnostic and lesional characterization, as part of maximum registration or nosological and diagnostic, through intermediate registration. The simplified recording system, based on a profile of bone abnormalities, offers an osteobiographical characterization and aimed highlighting the potentiality for paleopathological studies.
The standardized and automated running of the tool helps and facilitates recording, while reducing the time required for process, archive, and exploited data. It also optimizes the response to legal obligations specific to commercial archaeology, the first of which is the production of a report, by the immediate availability of reliable and flexible results according to different criteria (age, sex, chronology, etc.).
The tool was tested, through the application of the maximum and simplified recording protocol, to 231 skeletons from four osteoarchaeological series and support its applicability within the time allowed generally to an anthropological study in the context of commercial archaeology. In addition, the results generated by automated exploitation have demonstrated its effectiveness and its scope for establishing the paleopathological or osteobiographical profile of a series, particularly through the attenuation or circumvention of major theoretical and methodological biases by multicriteria filters applied to the data.