Soutenance de thèse de JOURDAN Pauline
Titre de thèse
Contribution à l'épidémiologie des virus West Nile et Usutu en France
Epidemiological Study of West Nile and Usutu Viruses in France
Résumé de la thèse
Les virus West Nile (WNV) et Usutu (USUV) sont des Flavivirus dont le cycle enzootique implique les oiseaux comme réservoirs et les moustiques Culex comme vecteurs. Ils infectent des hôtes accidentels comme l'homme ou le cheval. Chez les humains, l'infection est généralement asymptomatique ou paucisymptomatique, mais les personnes âgées ou immunodéprimées peuvent développer des formes neurologiques sévères. Le WNV circule en France depuis les années 1960, tandis que USUV n'a été détecté qu'en 2015. Il n'existe pas actuellement de données nationales de séroprévalence pour ces virus en France. L'objectif de ma thèse était donc de contribuer à l'épidémiologie de WNV et USUV en France en analysant le potentiel d'hivernage des virus chez les moustiques et en déterminant la séroprévalence de WNV et USUV chez les donneurs de sang français et les facteurs de risque associés. Nos résultats montrent l'absence de ces 2 virus chez 10617 moustiques hivernants dans le nord-est de la France, suggérant qu'ils ne maintiennent pas l'infection en hiver. De plus grâce à une stratégie de pool des échantillons, nous avons montré, à l'aide de sérums de 44 490 donneurs prélevés en 2021-2022, une séroprévalence globale faible (0,84% en pools et 0,94 % individuellement). Les principaux facteurs de risque identifiés étaient la résidence dans le Sud (Occitanie, PACA, Corse) et le groupe sanguin O. Enfin, la séroprévalence de USUV dans onze départements a été réalisée et celle de la France entière est en cours de modélisation. Cette thèse contribue à l'avancement des connaissances sur l'épidémiologie de WNV et USUV, aussi bien sur un plan entomologique que sur le plan sérologique.
Thesis resume
West Nile virus (WNV) and Usutu virus (USUV) are flaviviruses whose enzootic cycle involves birds as reservoirs and Culex mosquitoes as vectors. They infect accidental hosts such as humans and horses. In humans, infections are generally asymptomatic or paucisymptomatic, but elderly or immunocompromised individuals may develop severe neurological forms. WNV has been circulating in France since the 1960s, while USUV was only detected in 2015. There are currently no national seroprevalence data for these viruses in France. The aim of my thesis was therefore to contribute to the epidemiology of WNV and USUV in France by analysing the potential of overwintering of these viruses in mosquitoes and determining the seroprevalence of WNV and USUV in French blood donors and the associated risk factors. Our results show the absence of these two viruses in 10,617 overwintering mosquitoes in north-eastern France, suggesting that they do not maintain infection during the winter. In addition, using a sample pooling strategy, we demonstrated a low overall seroprevalence (0.84% in pools and 0.94% individually) using sera from 44,490 donors collected in 2021-2022. The main risk factors identified were residence in the south (Occitanie, PACA, Corsica) and blood group O. Finally, USUV seroprevalence was determined in eleven departments, and modelling for the whole of France is currently underway. This thesis contributes to advancing knowledge on the epidemiology of WNV and USUV, both from an entomological and serological perspectives.