L'étude du pan-genome de bactéries pathogènes.

Coordonnées

laetitia.rouli@gmail.com

Expérience professionelle

Type de contrat : En recherche d'emploi

Techniques maîtrisées

Informatique : - Langages : Perl. - Web: HTML, PHP, CSS. - Autres: Linux. Base de données (SQL). Bioinformatique : - outils de phylogénie et base de données. - analyse de données 454, SOLiD, MiSeq, PGM. - assemblage de génomes - étude du pangenome

Doctorat

Intitulé : Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses
1ère inscription en thèse : Novembre 2011
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Date de soutenance de la thèse : 31 Octobre 2014
Sujet : Etude systématique des génomes bactériens.
Directeur de thèse : Didier RAOULT
Co-directeur :
Unité de recherche : URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales
Intitulé de l'équipe :

Master

Intitulé : Bioinformatqie, Biochimie Structurale et Génomique
Septembre 2011 - U2 - Luminy
Mention : Assez Bien

Langues vivantes

Allemand : B1 - Intermédiaire
Italien : B1 - Intermédiaire
Anglais : B1 - Intermédiaire

Production scientifique

  • Genomic comparison of Kingella kingae strains.
    J Bacteriol 2012
    Fournier PE, Rouli L, El Karkouri K, Nguyen TT, Yagupsky P, Raoult D
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23045489
  • Q fever and pregnancy: disease, prevention, and strain specificity.
    Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2012
    Angelakis E, Million M, D'Amato F, Rouli L, Richet H, Stein A, Rolain JM, Raoult D.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23052984
  • Genome Sequence of Coxiella burnetii 109, a Doxycycline-Resistant Clinical Isolate.
    J Bacteriol. 2012
    Rouli L, Rolain JM, El Filali A, Robert C, Raoult D.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23209205
  • The genome of Coxiella burnetii Z3055, a clone linked to the Netherlands Q fever outbreaks, provides evidence for the role of drift in the emergence of epidemic clones.
    Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2014
    D'Amato F, Rouli L, Edouard S, Tyczka J, Million M, Robert C, Nguyen TT, Raoult D
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25249233