L'étude du pan-genome de bactéries pathogènes.
Coordonnées
laetitia.rouli@gmail.com
Expérience professionelle
Type de contrat : En recherche d'emploi
Techniques maîtrisées
Informatique :
- Langages : Perl.
- Web: HTML, PHP, CSS.
- Autres: Linux. Base de données (SQL).
Bioinformatique :
- outils de phylogénie et base de données.
- analyse de données 454, SOLiD, MiSeq, PGM.
- assemblage de génomes
- étude du pangenome
Doctorat
Intitulé : Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses
1ère inscription en thèse :
November 2011
École doctorale :
Sciences de la Vie et de la Santé
Date de soutenance de la thèse :
31 October 2014
Sujet :
Etude systématique des génomes bactériens.
Directeur de thèse :
Didier RAOULT
Co-directeur :
Unité de recherche :
URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales
Intitulé de l'équipe :
Master
Intitulé : Bioinformatqie, Biochimie Structurale et Génomique
September 2011 - U2 - Luminy
Mention : Assez Bien
Langues vivantes
Allemand : B1 - Intermédiaire
Italien : B1 - Intermédiaire
Anglais : B1 - Intermédiaire
Production scientifique
-
Genomic comparison of Kingella kingae strains.
J Bacteriol
2012
Fournier PE, Rouli L, El Karkouri K, Nguyen TT, Yagupsky P, Raoult D
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23045489
-
Q fever and pregnancy: disease, prevention, and strain specificity.
Eur J Clin Microbiol Infect Dis
2012
Angelakis E, Million M, D'Amato F, Rouli L, Richet H, Stein A, Rolain JM, Raoult D.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23052984
-
Genome Sequence of Coxiella burnetii 109, a Doxycycline-Resistant Clinical Isolate.
J Bacteriol.
2012
Rouli L, Rolain JM, El Filali A, Robert C, Raoult D.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23209205
-
The genome of Coxiella burnetii Z3055, a clone linked to the Netherlands Q fever outbreaks, provides evidence for the role of drift in the emergence of epidemic clones.
Comp Immunol Microbiol Infect Dis.
2014
D'Amato F, Rouli L, Edouard S, Tyczka J, Million M, Robert C, Nguyen TT, Raoult D
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25249233