Monsieur Cheikh HOUMENOU / Docteur


enseignant-chercheur, enseignant du supérieur*chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*

Coordonnées

Adresse professionnelle

143 Traverse de la Gouffonne, 13385 MARSEILLE 5E ARRONDISSEMENT , FRANCE

0699813836

Expérience professionnelle

Emplois

Mobilité ? : Partout en Europe, Aux Etats-unis, en Australie, au Canada et en Afrique

Disponibilité : 12 2025

Mobilité géographique : France

Recherche : OUI

Techniques maîtrisées

Bioinformatique Intelligence artificielle Developpement d'outils et de pipelines Traitement de données Data science

Doctorat

Titre : RECHERCHES BIOMEDICALES Maladies infectieuses et microbiote

1ère inscription en thèse : 1 janvier 2022 / 3A

Ecole doctorale : Recherches Biomédicales

Date de soutenance de thèse : 17 décembre 2025

Sujet : Application des outils bio-informatiques pour l'étude de la diversité et de la dynamique de circulation des micro-organismes dans les environnements naturels et hospitaliers

Directeur de thèse : SOKHNA Cheikh

Co-directeur : MEDIANNIKOV Oleg

Unité de recherche : MEPHI - Microbes Evolution Phylogénie et Infections

Equipe : MEPHI - E7 - Biologie de l'évolution

Master

Titre : Bioinformatic-DLAD

juillet 2020 - Aix-Marseille Université

Production scientifique

  • Advancements and Challenges in Bioinformatics Tools for Microbial Genomics in the Last Decade: Toward the Smart Integration of Bioinformatics Tools, Digital Resources, and Emerging Technologies for the Analysis of Complex Biological Data.
    Infection, Genetics and Evolution, 2025
    Cheikh Tidiane Houmenou, Cheikh Sokhna, Florence Fenollar and Oleg Mediannikov
    https://doi.org/10.1016/j.meegid.2025.105859
  • Comparative 16S rRNA metabarcoding analysis of gut bacterial diversity across seven termite species from Senegal: ecological roles and community structure
    Scientific reports, 2025
    Cheikh Tidiane HOUMENOU, Mapenda GAYE, Cheikh SOKHNA, Florence FENOLLAR, Oleg MEDIANNIKOV
    https://submission.springernature.com/submission-details/017fb1c9-aafc-4a9e-8fc2-a51384b971ca?_gl=1*1l2h1qp*_ga*MzAyMzI5MDgzLjE3Mjk4MDIzMDY.*_ga_B3E4QL2TPR*czE3NjQ4NzY3OTEkbzI2JGcwJHQxNzY0ODc2NzkzJGo1OCRsMCRoOTkwMjkxMDc3
  • Evidence of circulation of Klebsiella pneumoniae isolates among termites, chimpanzees, and humans
    Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2024
    Cheikh Tidiane HOUMENOU Habibou SARR, Seydina M. DIENE, Idir KACEL, Cheikh SOKHNA, Florence FENOLLAR and Oleg MEDIANNIKOV
    https://doi.org/10.1016/j.jgar.2025.05.028

Langues

Français : C2 - Courant

Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur

Wolof : C2 - Maternel