Monsieur Cheikh HOUMENOU / PhD

enseignant-chercheur, enseignant du supérieur*chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*

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houmenou1@gmail.com

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143 Traverse de la Gouffonne, 13385 MARSEILLE 5E ARRONDISSEMENT , FRANCE

0699813836

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Jobs

Comments on mobility : Partout en Europe, Aux Etats-unis, en Australie, au Canada et en Afrique

Availability : 12 2025

Mobility : France

Research : OUI

Techniques

Bioinformatique Intelligence artificielle Developpement d'outils et de pipelines Traitement de données Data science

PhD

Title : RECHERCHES BIOMEDICALES Maladies infectieuses et microbiote

First registration date : 1 January 2022 / 3A

Doctoral school : Recherches Biomédicales

Thesis defense date : 17 December 2025

Subject : Application des outils bio-informatiques pour l'étude de la diversité et de la dynamique de circulation des micro-organismes dans les environnements naturels et hospitaliers

Thesis supervisor : SOKHNA Cheikh

Thesis co-supervisor : MEDIANNIKOV Oleg

Research unit : MEPHI - Microbes Evolution Phylogénie et Infections

Team : MEPHI - E7 - Biologie de l'évolution

Master's degree

Title : Bioinformatic-DLAD

July 2020 - Aix-Marseille Université

Publications

  • Advancements and Challenges in Bioinformatics Tools for Microbial Genomics in the Last Decade: Toward the Smart Integration of Bioinformatics Tools, Digital Resources, and Emerging Technologies for the Analysis of Complex Biological Data.
    Infection, Genetics and Evolution, 2025
    Cheikh Tidiane Houmenou, Cheikh Sokhna, Florence Fenollar and Oleg Mediannikov
    https://doi.org/10.1016/j.meegid.2025.105859
  • Comparative 16S rRNA metabarcoding analysis of gut bacterial diversity across seven termite species from Senegal: ecological roles and community structure
    Scientific reports, 2025
    Cheikh Tidiane HOUMENOU, Mapenda GAYE, Cheikh SOKHNA, Florence FENOLLAR, Oleg MEDIANNIKOV
    https://submission.springernature.com/submission-details/017fb1c9-aafc-4a9e-8fc2-a51384b971ca?_gl=1*1l2h1qp*_ga*MzAyMzI5MDgzLjE3Mjk4MDIzMDY.*_ga_B3E4QL2TPR*czE3NjQ4NzY3OTEkbzI2JGcwJHQxNzY0ODc2NzkzJGo1OCRsMCRoOTkwMjkxMDc3
  • Evidence of circulation of Klebsiella pneumoniae isolates among termites, chimpanzees, and humans
    Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2024
    Cheikh Tidiane HOUMENOU Habibou SARR, Seydina M. DIENE, Idir KACEL, Cheikh SOKHNA, Florence FENOLLAR and Oleg MEDIANNIKOV
    https://doi.org/10.1016/j.jgar.2025.05.028

Languages

Français : C2 - Courant

Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur

Wolof : C2 - Maternel