Soutenance de thèse de DIOUF Coumba
Titre de thèse
Etude épidémiologique des risques infectieux liés au Grand Magal de Touba au Sénégal
Epidemiological study of the infectious risks associated with th great Touba Magal in Senegal
Résumé de la thèse
Le Grand Magal de Touba (GMT) célébré chaque année au Sénégal attire environ 4 à 5 millions de pèlerins. Les infections respiratoires, gastro-intestinales et les maladies fébriles semblent fréquentes chez les pèlerins malades lors de leur séjour à Touba. Ce travail se compose de quatre axes :
1) Une revue de littérature sur les études portant sur de grands rassemblements en Afrique, décrivant la survenue d'infections ou la présence d'agents pathogènes chez les participants ou dans la population générale dans les zones où ces rassemblements ont eu lieu. les bases de données Pubmed et Google Scholar ont été consultées afin d'identifier toutes les études pertinentes. Finalement, 28 articles portant sur des événements religieux, sportifs et culturels répondaient aux critères d'inclusion et ont été inclus dans la synthèse qualitative de la revue.
2) Les fièvres et maladies vectorisées chez les patients fébriles consultant au centre de santé de Mbacké. Pendant le GMT (2018-2022), des pathogènes responsables de maladies fébriles ont été recherchés par PCR. 18,8% des patients étaient positifs pour Plasmodium falciparum et 5,1% pour la dengue. En outre, les performances des cassettes TDR Bioline™ et ParaHITR collectées lors des GMT de 2022 et 2023 ont été calculées par rapport à la PCR considérée comme test de référence. Les tests Bioline™ et ParaHITR avaient des spécificités respectives de 97,3% et 92,5%.
3) Les infections respiratoires chez les pèlerins. Les relations entre le portage d'agents pathogènes respiratoires et les symptômes cliniques respiratoires ont été étudiés sur 1067 pèlerins (2017-2023) dont 328 pèlerins asymptomatiques (témoins), 298 pèlerins symptomatiques mais qui n'ont pas consultés et 441 patients symptomatiques qui ont consulté. Les personnes symptomatiques étaient 53 fois plus susceptibles d'être testées positives à la grippe A, 2 fois plus à Streptococcus pneumoniae et à Moraxella catarrhalis. Une comparaison des résultats obtenus avant (2017-2019), pendant (2020-2021) et après (2022-2024) la pandémie de COVID-19 au Sénégal a montré que chez les pèlerins revenant du GMT, la prévalence du rhinovirus et des coronavirus endémiques a diminué pendant la pandémie tandis que la prévalence des virus grippaux a augmenté. Chez les patients de Mbacké, le virus de la grippe A était le plus courant et sa prévalence était nettement plus élevée. Après leur participation au GMT de 2024, Les pèlerins ont contracté le rhinovirus (10,5%), le para-influenza virus 1 (5,7%), les corona endémiques (2,9%), le SARS-CoV-2 (1,9%), le virus de la grippe A (1,9 %), l'adénovirus (0,9%) et le métapneumovirus (0,9%). 3,0% des membres de leurs familles ont contracté le rhinovirus. Aucun virus n'a été contracté par les témoins. En 2022, 45% des pèlerins ont déclaré des symptômes respiratoires et 7% étaient positifs au SARS-CoV-2 après avoir participé au GMT. 5% des patients consultant pour des symptômes respiratoires au centre de santé de Mbacké ont été positifs au SARS-CoV-2.
4) Les infections gastro-intestinales chez les pèlerins. Les parasites intestinaux ont été recherchés sur 513 échantillons et Aucun n'a été testé positif pour les helminthes bien que 2,8% des participants de la cohorte ont acquis Giardia lamblia. 9,2% des patients de Mbacké étaient positifs pour Giardia lamblia, 5,1% pour Cryptosporidum spp. et 2,0% pour Entamoeba histolytica. Par ailleurs, une diminution de la prévalence des bactéries pathogènes gastro-intestinales a été observée pendant la pandémie du COVID 19.
Ces deux approches ont permis de quantifier les risques d'infections respiratoires, digestives et des fièvres associés à la participation au pèlerinage, tout en identifiant les agents pathogènes responsables. Sur la base de nos résultats, le port du masque, l'hygiène des mains et la vaccination contre la grippe et les infections à pneumocoque chez les personnes à risque doivent être recommandées.
Thesis resume
The Grand Magal of Touba (GMT), celebrated annually in Senegal, attracts approximately 4 to 5 million pilgrims. Respiratory and gastrointestinal infections and febrile illnesses appear to be common among sick pilgrims during their stay in Touba. This study consists of four parts:
1) A literature review of studies on large gatherings in Africa, describing the occurrence of infections or the presence of pathogens among participants or in the general population in areas where these gatherings took place. Pubmed and Google Scholar were consulted to identify all relevant studies. Ultimately, 28 articles on religious, sporting, and cultural events met the inclusion criteria and were included in the qualitative synthesis of the review.
2) Fevers and vector-borne diseases in febrile patients consulting at the Mbacké health center. During the GMT (2018-2022), pathogens responsible for febrile illnesses were investigated using PCR. 18.8% of patients tested positive for Plasmodium falciparum and 5.1% for dengue. In addition, the performance of Bioline™ and ParaHITR TDR cassettes collected during the 2022 and 2023 GMT was calculated in relation to PCR, which was considered the reference test. The Bioline™ and ParaHITR tests had specificities of 97.3% and 92.5%, respectively.
3) Respiratory infections among pilgrims. The relationship between respiratory pathogen carriage and clinical respiratory symptoms was studied in 1,067 pilgrims (2017-2023), including 328 asymptomatic pilgrims (controls), 298 symptomatic pilgrims who did not seek medical attention, and 441 symptomatic patients who did seek medical attention. Symptomatic individuals were 53 times more likely to test positive for influenza A and twice as likely to test positive for Streptococcus pneumoniae and Moraxella catarrhalis. A comparison of the results obtained before (2017-2019), during (2020-2021), and after (2022-2024) the COVID-19 pandemic in Senegal showed that among pilgrims returning from the GMT, the prevalence of rhinovirus and endemic coronaviruses decreased during the pandemic, while the prevalence of influenza viruses increased. Among patients in Mbacké, influenza A virus was the most common and its prevalence was significantly higher. After participating in the 2024 GMT, pilgrims contracted rhinovirus (10.5%), parainfluenza virus 1 (5.7%), endemic coronaviruses (2.9%), SARS-CoV-2 (1.9%), influenza A virus (1.9%), adenovirus (0.9%), and metapneumovirus (0.9%). 3.0% of their family members contracted rhinovirus. No viruses were contracted by the controls. In 2022, 45% of pilgrims reported respiratory symptoms and 7% tested positive for SARS-CoV-2 after having
4) Gastrointestinal infections among pilgrims. Intestinal parasites were tested for in 513 samples, and none tested positive for helminths, although 2.8% of cohort participants acquired Giardia lamblia. 9.2% of patients in Mbacké tested positive for Giardia lamblia, 5.1% for Cryptosporidium spp., and 2.0% for Entamoeba histolytica. In addition, a decrease in the prevalence of gastrointestinal pathogens was observed during the COVID-19 pandemic.
These two approaches made it possible to quantify the risks of respiratory and digestive infections and fevers associated with participation in the pilgrimage, while identifying the responsible pathogens. Based on our results, mask wearing, hand hygiene, and vaccination against influenza and pneumococcal infections in at-risk individuals should be recommended.