Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Immunologie

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

Cytométrie en flux,Immunologie,Pathologies infectieuses,Diagnostic au lit du patient,

Keywords

Flow Cytometry,Immunology,Infectious diseases,Point-of-care,

Titre de thèse

Recherche de nouveaux tests rapides en cytométrie en flux pour l’établissement de diagnostics « aux lits des patients »: application à la discrimination des infections bactériennes et/ou virales en vue de réduire l’usage inutile des antibiotiques.
Development of new Point-Of-Care Flow Cytometry testing to distinguish between viral and bacterial infections and to reduce unnecessary uses of antibiotics.

Date

Thursday 13 February 2020 à 14:00

Adresse

Faculté des Sciences Médicales et Paramédicales secteur Timone (Aix-Marseille Université) 27 Bd Jean Moulin 13385 Marseille 2

Jury

Directeur de these M. Pierre-Emmanuel MORANGE C2VN
Rapporteur M. Jacques LEVRAUT CHU Nice
Rapporteur M. Mikaël ROUSSEL CHU Rennes
Examinateur Mme Marie LOOSVELD CHU Timone
Examinateur M. Philippe NAQUET CIML Marseille
CoDirecteur de these M. Fabrice MALERGUE Immunotech

Résumé de la thèse

Les maladies infectieuses sont des pathologies dont le diagnostic étiologique est souvent complexe. Le clinicien doit baser son diagnostic sur ses observations cliniques et les relier aux mesures biologiques du patient. Plusieurs groupes recherchent activement de nouveaux marqueurs biologiques pour préciser ce diagnostic. C’est dans cette optique que la cytométrie en flux a été utilisée et optimisée pour comparer l’expression de nouveaux biomarqueurs sur les cellules du sang des patients infectés ou des sujets sains. La caractérisation des mécanismes d’expression des marqueurs montre que l’expression du CD64 sur les neutrophiles est amplifiée chez les patients infectés par une bactérie via l’interféron γ, alors que l’expression du CD169 sur les monocytes est amplifiée chez les patients infectés par un virus via la famille des interférons de type I (α, β, ω). De plus, l’expression de l’HLA-DR sur les monocytes semble aider à l’identification étiologique de l’infection. Les travaux suggèrent que le dosage de ces trois biomarqueurs par la technique de cytométrie en flux optimisée pourrait être un candidat intéressant dans les études sur le diagnostic des infections bactériennes et virales.

Thesis resume

Infectious diseases are pathologies whose etiological diagnosis is often complex. The clinician must base his diagnosis on his clinical observations and link them to the patient's biological measurements. Several groups are actively seeking new biomarkers to clarify this diagnosis. It is for this purpose that flow cytometry has been used and optimized to compare the expression of new biomarkers on blood cells of infected patients or healthy subjects. Characterization of the expression mechanisms of the markers shows that the expression of CD64 on neutrophils is amplified in patients infected by a bacterium via interferon γ, whereas the expression of CD169 on monocytes is amplified in patients infected with a virus via the type I interferon family (α, β, ω). In addition, the expression of HLA-DR on monocytes seems to help the etiological identification of the infection. The work suggests that the assay of these three biomarkers combined into an optimized flow cytometry technique could be an interesting candidate in studies on the diagnosis of bacterial and viral infections.