Ecole Doctorale
SCIENCES CHIMIQUES - Marseille
Spécialité
Sciences Chimiques
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Arenavirus,Nucléases virales,Chélation de métaux,Dicéto-acides,
Keywords
Arenavirus,Viral nucleases,Metal chelation,Diketo-acids,
Titre de thèse
Développement de molécules antivirales contre les Arenavirus
Development of antivirals to fight against arenaviruses
Date
Vendredi 23 Novembre 2018 à 14:00
Adresse
Polytech Marseille - Parc scientifique et technologique de Luminy
163 avenue de Luminy -Case 925
13288 Marseille Cedex 09 Amphithéâtre Polytech
Jury
Directeur de these |
Mme Karine ALVAREZ |
Centre National de la Recherche Scientifique |
Rapporteur |
M. Marcel HIBERT |
Université de Strasbourg |
Rapporteur |
Mme Odile DECHY-CABARET |
Toulouse INP-ENSIACET |
Examinateur |
M. Xavier MORELLI |
Centre National de la Recherche Scientifique |
Examinateur |
M. Philippe COTELLE |
ENSCL (Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Lille) |
Examinateur |
Mme Olga IRANZO |
Centre National de la Recherche Scientifique |
Résumé de la thèse
La famille des Arenaviridae contient des virus transmis par les rongeurs responsables de maladies humaines notamment de graves fièvres hémorragiques dont la fièvre de Lassa qui infecte chaque année 300 000 personnes. Labsence actuelle de solutions thérapeutiques efficaces (vaccins et/ou antiviraux) en fait une priorité détude. Il est donc urgent didentifier de nouvelles cibles thérapeutiques et des antiviraux spécifiques associés. Le génome des Arénavirus code pour deux nucléases possédant des fonctions cruciales pour la survie du virus. La protéine L possède un domaine endonucléase indispensable à la réplication virale réalisant le mécanisme de vol de coiffe. La protéine NP comporte un domaine exonucléase impliqué dans léchappement au système immunitaire de lhôte infecté. Ces deux enzymes possèdent un mécanisme daction commun de clivage de leur ARN substrat via des ions métalliques Mg2+.
Ce projet:
1) se propose dapporter la preuve de concept que ces deux enzymes sont de nouvelles cibles thérapeutiques pour combattre les Arénavirus.
2) se base sur le criblage préalable dune chimiothèque de 1ère génération sur lendonucléase dun Arénavirus et la découverte dune famille de dicéto-acides (DCAs) inhibitrice de son activité.
Au cours de ce travail de thèse, une chimiothèque de 2nde génération de 22 composés a été synthétisée. Des voies de synthèses nouvelles et originales ont été développées. Les composés ont été évalués par des méthodes biophysiques pour leur capacité à se lier aux enzymes cibles, ont été évalués comme potentiels inhibiteurs dans des tests dactivité in vitro, et in cellula dans un test en mini-génome. Certains composés se sont montrés de bons ligands, actifs in vitro et in cellula.
Thesis resume
The Arenaviridae family comprises viruses transmitted by rodents responsible for several human diseases such as hemorragic fevers among which Lassa fever infects 300,000 people each year. The current lack of effective vaccines and/or antivirals makes the development of therapeutic solutions of high priority. The genome of Arenaviruses encodes for two nucleases bearing crucial functions for virus survival. The L protein bears an endonuclease domain essential for viral replication through the cap-snatching mechanism. The NP protein has an exonuclease domain involved in anti-immune activity. Both enzymes share a common mode of action as they cleave their RNA substrate via a metal-dependant (Mg2+) strategy.
This work intends to :
1)consider these two enzymes as novel Arenavirus therapeutic targets.
2)take over a preliminary screening of a 1st generation of ligands on an
Arenavirus endonuclease. Diketo-acids (DKAs) have been discovered as potential inhibitors of its activity.
To this end, a library of 2nd generation of 22 compounds was synthetized thanks to the development of an optimized synthesis pathway. Compounds were further evaluated by biophysical methods for their ability to bind therapeutic targets, as potential inhibitors in an in vitro assay and in cellula in a mini-genome assay. Some of them are active in vitro and in cellula.