Soutenance de thèse de BERANGER Aude


Titre de thèse

Étude de la réponse de la bactérie auxotrophe Lactococcus cremoris à l'hème et de son impact sur la chaîne de transfert d'électrons

Study of the response of the auxotrophic bacterium Lactococcus cremoris to heme and its impact on the electron transport chain

Date

30 janvier 2026 à 14h00

Adresse

31 chemin Joseph Aiguier, batiment N, 13009, Marseille, Amphithéatre P. Desnuelles

Ecole doctorale

Sciences du Vivant

Specialité

SCIENCES DU VIVANT Microbiologie et interactions hôte-pathogènes

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots clés

Lactococcus cremoris,hème,adaptation,chaîne de transfert d'électrons,hétérogénéité phénotypique,

Keywords

Lactococcus cremoris,heme,adaptation,electron transport chain,phenotypic heterogeneity,

Jury

Jury de thèse
Qualité Nom Etablissement
Directeur de recherche M. MAGALON Axel Laboratoire de Chimie Bactérienne, Aix-Marseille Université
Chargée de recherche Mme LECHARDEUR Delphine Institut Micalis, Université Paris-Saclay
Directeur de recherche M. PIERREL Fabien recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité (TIMC), Université Grenoble Alpes
Maîtresse de conférences Mme TACHON Sybille Laboratoire de Chimie Bactérienne, Aix-Marseille Université
Maîtresse de conférences Mme MORVAN Claire Institut Pasteur, Université Paris-Cité
Directeur de recherche M. CASCALES Eric Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Aix-Marseille Université

Résumé de la thèse

Lactococcus cremoris est une bactérie lactique traditionnellement décrite comme strictement fermentaire, qui possède pourtant une chaîne de transfert d'électrons (CTE) dont l'activation conduit à une augmentation de biomasse et une amélioration de la résistance cellulaire. Cette CTE est composée uniquement de NADH déshydrogénases, de ménaquinones et d'une réductase terminale, le cytochrome bd, dont l'activité dépend de l'hème, un cofacteur que
L. cremoris ne synthétise pas. Mon projet de thèse visait à élucider les mécanismes d'activation de cette CTE, jusqu'à présent mal compris.
Mes travaux montrent que L. cremoris peut activer en quelques minutes un pool préexistant d'apo-cytochrome bd lorsqu'elle détecte de faibles quantités d'hème dans l'environnement, révélant un processus de maturation post-traductionnelle rapide. Cette activation dépend strictement du transporteur CydCD, tandis que FhuCBGD, AhpC et HemW n'y participent pas. Mes travaux établissent également que les NADH déshydrogénases NoxA ou NoxB peuvent alimenter la CTE selon les conditions, conférant à l'espèce une flexibilité métabolique jusque-là sous-estimée.
Enfin, l'analyse de la production de CydAB grâce à une fusion CydB-GFP, révèle que les cellules de L. cremoris cultivées en présence d'oxygène avec ou sans hème présentent toutes le complexe à leur membrane en phase stationnaire tardive, alors qu'il est présent seulement dans une fraction des cellules cultivées en microaérobiose. Cette hétérogénéité liée à l'oxygénation pourrait constituer une stratégie d'adaptation, permettant à une partie de la population de réactiver rapidement leur CTE dès que l'hème devient disponible.


Thesis resume

Lactococcus cremoris is a lactic acid bacterium traditionally described as strictly fermentative, yet it possesses an electron transport chain (ETC) which, when activated, leads to increased biomass and enhanced cellular resilience. This ETC consists solely of NADH dehydrogenases, menaquinones and a terminal oxidase, the cytochrome bd, that require heme to be functional, a cofactor that L. cremoris cannot synthesize. My thesis project aimed to uncover the mechanisms underlying the activation of this ETC, previously poorly understood.
The present work shows that L. cremoris can activate a pre-existing pool of apo-cytochrome bd within minutes upon detecting trace amounts of extracellular heme, revealing a rapid post-translational maturation process. This activation strictly depends on the CydCD transporter, whereas FhuCBGD, AhpC and HemW do not contribute. The results further demonstrate that the NADH dehydrogenases NoxA or NoxB can fuel the ETC depending on environmental conditions, providing the species with a previously underestimated metabolic flexibility.
Finally, analysis of CydAB complex production using a CydB-GFP fusion reveals that
L. cremoris cells grown in the presence of oxygen with or without heme all show the complex at their membrane in the late stationary phase, whereas it is present only in a fraction of the cells grown in microaerobic conditions. This oxygen-dependent heterogeneity may represent an adaptive strategy enabling part of the population to rapidly reactivate their ETC as soon as heme becomes available.