Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

microbiote,moustiques,vecteurs,trophique,

Keywords

microbiota,mosquitoes,vector,host,

Titre de thèse

Mise au point et application de technologie innovante pour l'étude des moustiques de leur préférence trophique et de leur microbiote.
Developed innovative technology application for the study of mosquitoes in their microbiota and host preference

Date

Jeudi 5 Juillet 2018

Adresse

VITROME, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection, 19-21 Boulevard Jean Moulin 13385 Marseille Cedex 05, France. n°1

Jury

Directeur de these M. Philippe PAROLA VITROME, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection.
Examinateur M. Ogobara DOUMBO Department of Epidemiology of Parasitic Diseases, Malaria Research and Training Center, Faculty of Sciences and Techniques, University of Science, Techniques and Technologies of Bamako, Bamako, Mali.
Rapporteur M. Pascal DELAUNAY Service de Parasitologie-Mycologie CHU de Nice Hôpital de l'Archet
Rapporteur M. Vincent ROBERT MIVEGEC Unit, IRD -CNRS -Univ. Montpellier, Montpellier, France.
Examinateur Mme Christelle DESNUES CR1,CNRS UMR:MEPHI,AMU

Résumé de la thèse

Les moustiques sont les principaux vecteurs incriminés dans la transmission d’agents pathogènes à l’homme. L’identification précise des espèces de moustiques est importante pour distinguer les espèces vectrices des non vectrices. La détermination de l’origine du repas sanguin des moustiques vecteurs est indispensable dans la compréhension du comportement des espèces vectrices. Ces paramètres sont nécessaires pour la prévention du risque de transmission de maladie infectieuse. Dans ce travail, nous avons mise à jour le répertoire des moustiques du Mali, fait la mise au point de la spectrométrie de masse MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time of Flight) pour l’identification de ces moustiques de leur repas sanguin et de leur microbiote digestif. Le premier objectif est de faire la mise à jour de la littérature actuelle sur la faune Culicidienne au Mali, les potentiels vecteurs et les pathogènes transmis. Nous avons également décrit les avancées dans la lutte contre les moustiques vecteurs et les outils innovants récents pour l'identification des espèces de moustiques utilisés au Mali. Ainsi, nous avons listé 106 espèces de moustiques actuellement enregistrée au Mali dont 28 Anophelinae et 78 Culicinae. Nous avons de plus mis en évidence l’introduction récente de deux espèces de moustiques invasives Aedes albopictus et Culex neavei. Le deuxième objectif est d'évaluer l’efficacité de la spectrométrie de masse MALDI-TOF a identifié les moustiques collectés au Mali et déterminé leur source de repas sanguin. Les résultats obtenus montrent la capacité de la spectrométrie de masse MALDI-TOF a identifié les moustiques collectés au Mali et leur source de repas sanguin. Ainsi, huit espèces de moustiques ont été identifiées au Mali, dont Anopheles gambiae Giles, Anopheles coluzzii, Anopheles arabiensis, Culex quinquefasciatus, Culex neavei, Culex perexiguus, Aedes aegypti et Aedes fowleri. De plus, l’identification de la source de repas de sanguin nous a montré une grande antropophilie de ces moustiques. Le troisième objectif de ce travail est la mise au point de la culturomique et de la spectrométrie de masse MALDI-TOF pour l’étude du microbiote digestif des moustiques collectés sur le terrain notamment dans la ville de Marseille et au Mali. Ainsi, l'approche culturomique utilisée dans ce travail a révélé une grande diversité du microbiote digestif des moustiques Anopheles gambiae, Aedes albopictus et Culex quinquefasciatus. La majorité de ces bactéries étaient des grams négatives et appartiennent au phylum des Protéobacteria. De plus, une nouvelle espèce bactérienne, Pseudomonas massiliensis, a été isolée dans l’estomac des moustiques Anopheles gambiae et Culex quinquefasciatus et leurs eaux de gîte collectées au Mali.

Thesis resume

Mosquitoes are the main vectors implicated in the transmission of pathogens to humans. Accurate identification of mosquito species is important to distinguish between vector and non-vector species. The mosquito blood meal determination is essential in understanding the behavior of vector species. These parameters are necessary for the prevention of the transmission risk of infectious disease. In this work, we have updated the repertoire of Malian mosquitoes and developed the MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization - Time of Flight) tool for these mosquitoes identification, their meal blood determination and their microbiota study. The first objective is to update the current literature on Malian Culicidan fauna, potential vectors and pathogens transmitted. We also described advances in mosquito vector control and recent innovative tools used for mosquito identification. Thus, we have listed 106 mosquito species currently recorded in Mali, including 28 Anophelinae and 78 Culicinae. We have also highlighted the recent introduction of two invasive mosquito species Aedes albopictus and Culex neavei. The second aim is to evaluate the effectiveness of MALDI-TOF MS identified mosquitoes collected in Mali and determined their blood meal source. The results obtained show the capacity of the MALDI-TOF MS identified mosquitoes collected in Mali and their blood meal source. Thus, eight mosquito species were identified, including Anopheles gambiae Giles, Anopheles coluzzii, Anopheles arabiensis, Culex quinquefasciatus, Culex neavei, Culex perexiguus, Aedes aegypti and Aedes fowleri. In addition, the identification of the blood meal source matched with human blood (n = 619), chicken blood (n = 9), cow's blood (n = 9), donkey blood (n = 6), dog's blood (n = 5) and sheep blood (n = 3). The third objective is the MALDI-TOF and culturomics development for the microbiota study of the mosquito collected in the field, particularly in Marseille and Mali. Thus, the culturomics approach revealed a great diversity of the digestive microbiota of the Anopheles gambiae, Aedes albopictus and Culex quinquefasciatus mosquitoes. The majority of the bacteria detected in the mosquito microbiota was gram-negative and belong to the Proteobacteria phylum. In addition, a new bacterial species, Pseudomonas massiliensis, was isolated from the Anopheles gambiae and Culex quinquefasciatus microbiota and their breeding waters collected in Mali.