Soutenance de thèse de WATIER Stéphanie


Titre de thèse

Apport du diagnostic syndromique dans l'investigation des toxi-infections alimentaires collectives au sein des Forces armées françaises

Contribution of syndromic diagnosis in the investigation foodborne disease outbreaks within the French Armed Forces

Date

27 novembre 2025 à 14h00

Adresse

Faculté des Sciences Médicales et Paramédicales secteur Timone (Aix-Marseille Université), 27 Bd Jean Moulin, 13005 Marseille, Salle de visioconférence, RDC aile bleue, bâtiment médecine

Ecole doctorale

Recherches Biomédicales

Specialité

RECHERCHES BIOMEDICALES Maladies infectieuses et microbiote

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots clés

toxi-infection alimentaire collective,diagnostic syndromique,PCR multiplex,enquête épidémiologique,méthode alternative en microbiologie alimentaire,Forces armées françaises,

Keywords

foodborne disease oubtreak,syndromic diagnosis,multiplex PCR,epidemiological investigation,alternative food microbiology method,French Armed Forces,

Jury

Jury de thèse
Qualité Nom Etablissement
Professeur agrégé M. MEYNARD Jean-Baptiste Ministère des armées - Service de santé des armées - Direction centrale du service de santé des armées
Professeure des universités Mme DUBOIS-BRISSONNET Florence AgroParisTech, Université Paris-Saclay
Professeur des universités - praticien hospitalier M. VANHEMS Philippe Université Claude Bernard - CHU-Hospices de Lyon
Professeur agrégé M. POMMIER DE SANTI Vincent Ministère des armées - Service de santé des armées - Centre d'épidémiologie et de santé publique des armées
Professeur des universités - praticien hospitalier M. GAUDART Jean Université d'Aix-Marseille
Professeur agrégé M. BONI Mickeal Ecole du val de Grâce

Résumé de la thèse

Les toxi-infections alimentaires collectives (TIAC) représentent un problème de santé publique majeur dans le monde. Si les pays à faible revenu paient le plus lourd tribut sanitaire, les pays développés sont aussi concernés par cette problématique. Dans les Forces armées françaises, les TIAC ont une importance sanitaire non négligeable, avec un retentissement individuel et collectif (capacité opérationnelle des troupes). Entre 1999 et 2013, environ 250 foyers de TIAC ont été déclarés dans les armées, causant plus de 6 700 malades. Un agent étiologique concordant entre les échantillons prélevés chez les malades et les échantillons alimentaires a été identifié dans environ 20% des foyers, suggérant une marge de progression dans l'efficacité de l'investigation des TIAC, facteur-clé d'une meilleure prévention. Cette thèse a pour objectif d'élaborer une nouvelle méthode d'investigation des TIAC au sein des Forces armées françaises, basée sur une approche syndromique. La première partie propose un état des lieux sur les dispositifs de surveillance et de notification des TIAC existant à l'échelle internationale et en France, ainsi que sur les méthodes et les résultats d'investigation de ces événements. Ce bilan porte également sur les facteurs de réussite ou d'échec de l'investigation des TIAC, afin d'identifier des pistes de progression pour améliorer l'efficacité de l'investigation de ces événements. La seconde partie porte sur la révision du protocole d'investigation des TIAC dans les Forces armées françaises, afin de proposer une méthode plus adaptée et de nouveaux outils pour conduire ces investigations. La troisième partie a porté sur la mise en œuvre et l'évaluation du diagnostic syndromique, mis en œuvre sur les échantillons de selle de patients et sur les échantillons de denrées, lors des investigations de TIAC, à travers des exemples d'enquêtes menées en population militaire et utilisant cette approche. Enfin, dans une dernière partie, les résultats agrégés des investigations des TIAC menées dans les armées françaises, selon l'ancienne et la nouvelle méthode, ont été comparés. A partir de ce bilan, des projets d'actions sont mis en perspective afin de poursuivre le processus d'amélioration de l'investigation des TIAC au sein des Forces armées françaises.


Thesis resume

Foodborne illness outbreaks (FBDO) are a major public health issue worldwide. While low-income countries bear the heaviest health burden, developed countries are also concerned by this issue. Within the French Armed Forces, FBDO are a significant health issue, with individual and collective impacts (troops' operational capacity). Between 1999 and 2013, about 250 FBDO were reported in the French Armed forces, causing more than 6,700 cases of illness. A concordant etiological agent between samples taken from patients and food samples was identified in approximately 20% of outbreaks, suggesting scope for improvement in the efficiency of FBDO investigation, a key factor in better prevention. The aim of this thesis is to develop a new method for investigating FBFO within the Armed Forces, based on a syndromic approach. The first part provides an overview of the systems in place for monitoring and reporting FBDO at the international level and in France, as well as the methods used to investigate these events and the results obtained. This review also examines the factors contributing to the success or failure of FBDO investigations, with a view to identifying areas for improvement in order to enhance the effectiveness of investigations. The second part focused on revising the protocol for investigating FBDO in the French Armed Forces, with an aim to propose a more appropriate method and new tools for conducting these investigations. The third part focused on the implementation and evaluation of syndromic diagnosis, carried out on both patient stool samples and food samples during FBDO investigations, through examples of surveys using this approach carried out within the French Armed Forces. Finally, in the last part, the aggregated results of FBDO investigations within French military population, obtained using the old and new methods, were compared. Based on this assessment, action plans are being developed to continue the process of improving the investigation of FBDO within the French Armed Forces.