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Doctorat

Intitulé : Biologie-Santé - Spécialité Bioinformatique et Génomique
1ère inscription en thèse : Octobre 2016
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Date de soutenance de la thèse : 22 Novembre 2019
Sujet : Etude génomique des interactions entre les Acanthamoeba et les virus géants
Directeur de thèse : Anthony LEVASSEUR
Co-directeur : Philippe COLSON
Unité de recherche : MEPHI - Microbes Evolution Phylogénie et Infections
Intitulé de l'équipe : MEPHI - E4 - Viromes humains, et (mega)viromes animaux et environnementaux dans le microbiote

Master

Intitulé : Bioinformatique, biochimie structurale et génomique
Septembre 2016 - AMU
Mention : Bien

Langues vivantes

Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur
Arabe : C2 - Maternel
Français : Maternel

Production scientifique

  • Deciphering the genomes of 16 Acanthamoeba species does not provide evidence of integration of known giant virus-associated mobile genetic elements
    Virus Research 2018
    Nisrine Chelkha, Philippe Colson, Anthony Levasseur, Bernard La Scola
  • Discovery and Further Studies on Giant Viruses at the IHU Mediterranee Infection That Modified the Perception of the Virosphere
    Viruses 2019
    Clara Rolland, Julien Andreani, Amina Louazani, Sarah Aherfi, Rania Francis, Rodrigo Rodrigues, Ludmila Silva, Dehia Sahmi, Said Mougari, Nisrine Chelkha, Meriem Bekliz, Lorena Silva, Felipe Assis, Fabio Dornas, Jacques Khalil, Isabelle Pagnier, Christelle Desnues, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Jonatas Abrahao, Bernard Scola
  • Draft genome and description of Merdibacter massiliensis gen.nov., sp. nov., a new bacterium genus isolated from the human ileum
    Scientific Reports 2019
    Hussein Anani, Rita Abou Abdallah, Nisrine Chelkha, Anthony Fontanini, Davide Ricaboni, Morgane Mailhe, Didier Raoult, Pierre-Edouard Fournier
    https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02158950/document
  • A Phylogenomic Study of Acanthamoeba polyphaga Draft Genome Sequences Suggests Genetic Exchanges With Giant Viruses
    Frontiers in Microbiology 2018
    Nisrine Chelkha, Anthony Levasseur, Pierre Pontarotti, Didier Raoult, Bernard La Scola, Philippe Colson