Madame Emeline LEMARIE / Docteur

Compétences

Compétences techniques et bioinformatique: - Utiliser des outils de laboratoire de recherche (spectrophotomètre (Nanodrop), centrifugeuse, thermocycleur, un instrument de purification (AKTA)). - Utiliser des logiciels simples de bio-informatique et interprétation des résultats (BLAST, Phylogeny, Snapgene, ORF Finder, NetLogo, Expasy) - Utilisation de bases de données (Uniprot, KEGG, INTERPRO) - Analyser des résultats à partir de données de mesure - Appliquer des méthodes de purification et de séparation - Gérer un projet scientifique - Rédiger tous types de rapports scientifiques (article, compte-rendu) - Utiliser les logiciels Microsoft (Word, Excel et Powerpoint)

Techniques maîtrisées

Bactériologie : - Réaliser et analyser des tests microbiologiques pour l'industrie alimentaire et cosmétique (respect des critères microbiologiques, dénombrement de microorganismes) - Analyser et maîtriser les risques microbiologiques dans l'industrie - Elaborer et améliorer des protocoles de contrôle et qualité de produits industriels - Rechercher et développer des solutions à des fins industrielles (état de l'art, étude de marché) - Mettre en application un protocole et analyser les résultats : - Maîtriser des techniques de microscopie Biochimie : - Mettre en application et analyser les résultats : extraction d'ADN plasmidique, purification d'ADN, test enzymatique par colorimétrie, test d'interaction de protéines par un agent de réticulation (« cross-linking » au formaldéhyde), séparation de protéines en fonction de leurs masses moléculaires (SDS-PAGE), dosage de protéines par la méthode de Lowry, purification de protéines par chromatographie d'affinité. - Préparer des solutions à une concentration donnée ou pH donné - Réaliser un dosage enzymatique ou de protéines Biologie moléculaire : - Mettre en application et analyser les résultats : clonage d'ADN, amplification d'ADN par PCR, insertion d'un vecteur d'ADN chez une bactérie (transformation bactérienne), construction d'une séquence d'ADN par megapriming, test d'infection phagique sur des bactéries, test d'interaction entre deux protéines par double hybride et gel retard, détection d'une protéine par immunomarquage (Western blot), séparation d'ADN en fonction de leurs masses moléculaires (électrophorèse sur gel d'agarose). Biologie de synthèse : - Produire d'une protéine ou molécule chimique d'intérêt industriel chez un châssis bactérien. - Etude approfondie sur la spécificité de substrat d'une enzyme - Production et étude de champignons microscopique