Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

Arthropodes,MALDI-TOF MS,Biologie moléculaire,,

Keywords

Artropods,MALDI-TOF MS,Molecular biology,,

Titre de thèse

DEVELOPPEMENT ET UTILISATION D’OUTILS INNOVANTS EN ENTOMOLOGIE MEDICALE
Development and use of innovative tools in medical entomology

Date

Mercredi 6 Novembre 2019

Adresse

IHU Méditerranée Infection, 19-21 bd Jean Moulin, 13005 Marseille Amphithéâtre IHU

Jury

Directeur de these M. Philippe PAROLA UMR VITROME Institut Hospitalo-Universitaire - Méditerranée Infection
Examinateur Mme Florence FENOLLAR UMR VITROME Institut Hospitalo-Universitaire - Méditerranée Infection
Rapporteur Mme Christelle POMARES Centre Hospitalier Universitaire de Nice Faculté de Médecine, Université de Nice-Sophia Antipolis, Inserm U 1065 Hôpital de l'Archet
Rapporteur M. Pascal DELAUNAY Centre Hospitalier Universitaire de Nice Faculté de Médecine, Université de Nice-Sophia Antipolis, Inserm U 1065 Hôpital de l'Archet

Résumé de la thèse

Les vecteurs sont des arthropodes hématophages assurant la transmission biologique active des nombreux pathogènes (bactéries, virus et parasites), d’un animal à un autre, dont l’homme. Les agents infectieux transmis sont responsables de millions de cas d’infections humaines et animales et de décès chaque année à travers le monde. Les pathogènes transmis par ces arthropodes causent parfois des maladies émergentes ou réémergentes peu connues ou sous estimées surtout dans les pays du sud. La lutte anti-vectorielle et la surveillance épidémiologique des vecteurs sont essentielles dans les stratégies de lutte et de contrôle de ces maladies vectorielles. L’identification correcte des arthropodes, la détermination de l’origine du repas sanguin ainsi que la caractérisation du répertoire des pathogènes associés sont des étapes cruciales dans la lutte contre les vecteurs. Nos travaux ont ainsi porté sur une combinaison des méthodes (morphologie, moléculaire et MALDI-TOF MS) pour identification des arthropodes, la détermination de repas de sang et des pathogènes associés avec les hôtes et leurs arthropodes. Dans la première partie de notre travail, nous avons utilisé l’outil MALDI-TOF MS pour identifier des tiques collectées au Mali et conservées dans de l’éthanol 70%. Les tiques étaient aussi testées par la biologie moléculaire pour rechercher les microorganismes associés. Nous avons également identifiés par MALDI-TOF MS des moustiques collectés au Tchad et conservés avec du silicagel. L’origine animale du repas sanguin de ces moustiques a également pu être étudiée par cet outil. La seconde partie nous a permis de détecter à d’outils de biologie moléculaire des microorganimes dans des animaux (bœufs, moutons, chèvres, chevaux, ânes, rongeurs et insectivores) et leurs ectoparasites (tiques, puces et mites) en Algérie. Nos travaux nous ont donc permis de confirmer l’intérêt du MALDI-TOF MS en entomologie médicale, avec pour la première fois son application sur des moustiques collectés sur le terrain au sud, et de compléter le répertoire des agents associés aux arthropodes au Mali et en Algérie. Nos perspectives comprennent un travail de collaboration pour l’utilisation de ces outils innovants dans une étude des tiques de la République Démocratique du Congo.

Thesis resume

Vectors are blood-sucking arthropods that ensure the active biological transmission of many pathogens (bacteria, viruses and parasites) from one animal to another, including humans. Transmitted infectious agents are responsible for millions of cases of human and animal infections and deaths each year around the world. Pathogens transmitted by these arthropods sometimes cause emerging or re-emerging diseases that are little known or underestimated, especially in southern countries. Vector control and epidemiological surveillance of vectors are essential in strategies for the control and monitoring of these vector-borne diseases. The correct identification of arthropods, the determination of the origin of the blood meal and the characterization of the repertoire of associated pathogens are crucial steps in vector control. Our work thus focused on a combination of methods (morphology, molecular and MALDI-TOF MS) for identifying arthropods, determining blood meals and pathogens associated with hosts and their arthropods. In the first part of our work, we used the MALDI-TOF MS tool to identify ticks collected in Mali and stored in 70% ethanol. Ticks were also tested by molecular biology to look for associated microorganisms. We also identified by MALDI-TOF MS mosquitoes collected in Chad and preserved with silicagel. The animal origin of the blood meal of these mosquitoes could also be studied by this tool. The second part allowed us to detect microorganisms in animals (oxen, sheep, goats, horses, donkeys, rodents and insectivores) and their ectoparasites (ticks, fleas and mites) in Algeria using molecular biology tools. Our work therefore enabled us to confirm the interest of MALDI-TOF MS in medical entomology, with for the first time its application on mosquitoes collected in the field in the south, and to complete the directory of agents associated with arthropods in Mali and Algeria. Our perspectives include collaborative work to use these innovative tools in a study of ticks in the Democratic Republic of Congo.