Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Recherche Clinique et Santé Publique
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Analyse spatio-temporelle,Geo-epidemiologie,Données fonctionnelles,Paludisme,Clustering,Time series
Keywords
Spatio-temporal analysis,Geo-epidemiology,Functional data,Malaria,Clustering,Time series
Titre de thèse
L'analyse de la dynamique spatio-temporelle du paludisme par approche de
détection locale de foyers de persistance
The analysis of the spatio-temporal dynamics of malaria by the approach of
local detection of persistent foci
Date
Jeudi 16 Juillet 2020 à 14:00
Adresse
27 boulevard jean moulin 13005 Marseille France Visio-conference
Jury
Directeur de these |
M. Jean GAUDART |
Aix Marseille Université |
Examinateur |
M. Jacques DEMONGEOT |
Université Grenoble Alpes France |
Rapporteur |
Mme Annie ROBERT |
Université Catholique de Louvain (Belgique) |
Rapporteur |
Mme Florence FOURNET |
MIVEGEC (UM, CNRS 5290, IRD 224) |
Examinateur |
M. David NERINI |
Aix Marseille Université |
Examinateur |
M. Cheikh LOUCOUBAR |
Institut Pasteur de Dakar (Senegal) |
Résumé de la thèse
Pour accélérer le processus délimination du paludisme, lOMS recommande de développer des stratégies de luttes ciblées pour intensifier la réduction de la morbidité et de la mortalité. A lapproche de la phase délimination, la transmission devient plus faible et spatialement hétérogène, nécessitant ainsi danalyser le paludisme à léchelle locale, au niveau du sous-district ou du village.
Par ailleurs, lidentification de foyers de persistance du paludisme est un atout majeur pour accélérer le processus délimination du paludisme, grâce à des interventions ciblées. Cependant dans la littérature, la définition scientifique et les méthodes de détection des foyers ne sont pas unanimes. De plus, la localisation de ces foyers sont susceptibles de changer dans le temps dû en partie par lévolution temporelle des facteurs environnementaux, météorologiques, entre autres, modifiant la répartition géographique du paludisme.
A cet effet, une approche basée sur la méthode des données fonctionnelle a été proposée pour identifier des profils dynamiques de paludisme. Grâce à cette approche fonctionnelle, des indicateurs épidémiologiques comme le démarrage, laccélération, le pic, le ralentissement, les moments de recrudescence et la fin de lépidémie, ont été définis sur la base des vitesses et accélérations des profils de paludisme. La finalité était de proposer des outils permettant de guider les stratégies dintervention par un ciblage des zones prioritaires et des dates pertinentes pour les mettre en uvre.
Ce travail de thèse a été appliqué dans deux pays de la Région africaine de lOMS de réalités épidémiologiques et environnementales différentes: le Sénégal et lAfrique du Sud.
Thesis resume
To accelerate the process of malaria elimination, WHO recommends developing targeted control strategies to intensify the reduction of morbidity and mortality. As the elimination phase approaches, transmission becomes low and spatially heterogeneous, thus necessitating analysis of malaria at the local level, sub-district or village.
In addition, the identification of persistent malaria foci is a major asset in accelerating the process of malaria elimination through targeted interventions. However, in the literature, the scientific definition and methods of detecting foci are not unanimous. Moreover, the location of these foci are likely to change over time due in part to the temporal evolution of environmental, meteorological and other factors that modify the spatial distribution of malaria.
Thus, an approach based on the functional data method has been proposed to identify dynamic malaria patterns. Thanks to this functional approach, epidemiological indicators such as onset, acceleration, peak, slowdown, moments of recrudescence and end of the epidemic were defined on the basis of the velocities and accelerations of malaria patterns.
The aim was to propose tools to guide intervention strategies by targeting priority areas and relevant dates for implementation.
This thesis work was applied in two countries of the WHO African Region with different epidemiological and environmental realities: Senegal and South Africa.