Soutenance de thèse de Florence PETIT

La génétique des populations en anthropologie, au cœur d’une approche pluridisciplinaire, tente de discerner ce qui relève de la sélection naturelle ou culturelle, de la démographie et de l’histoire des peuplements, dans l’explication de la répartition actuelle de la diversité génétique humaine. Mon travail de thèse, en trois parties, est fondé sur la recherche d’une meilleure connaissance et compréhension de la distribution géographique des polymorphismes du globule rouge : les antigènes de surface définissant les systèmes de groupes sanguins érythrocytaires (GSE) et un polymorphisme du cytoplasme, la glucose-6-phosphate déshydrogénase (G6PD). La première partie correspond à l’analyse, sur 75 populations d’Eurasie, des fréquences de l’allèle DI*01 codant pour l’antigène Diego a du système de GSE Diego, des haplotypes C2-M217 et C2-M401 du chromosome Y, des coordonnées géographiques et des langues, et a pu montrer la corrélation entre ces différents marqueurs. La répartition de l’allèle DI*01 semble suivre les conquêtes mongoles, porté par les nomades de langues Altaïques présentant les haplotypes C2-M217 et C2-M401 du chromosome Y, avec une expansion radiale depuis la Mongolie, ce qui n’avait jusqu’alors pas été démontré. Abordant les relations santé-environnement, la seconde partie étudie le gène G6PD chez 80 individus de Guyane Française de la communauté des Noirs Marrons originaire d’Afrique sub-Saharienne. Les mutations du déficit en G6PD caractéristiques des variants sub-Sahariens, ont été retrouvées chez une personne sur huit. La répartition du déficit était jusqu’alors inconnue en Guyane Française et est encore mal connue dans les pays d’Amérique Latine et dans les Caraïbes, dans la plupart desquels sévit encore Plasmodium vivax dont le traitement nécessite l’utilisation de la primaquine pouvant entraîner une hémolyse sévère chez les individus G6PD-déficients. Dans la dernière partie, mon objectif a été de confirmer ou de mettre en évidence l’influence de différents facteurs environnementaux et culturels sur la répartition des polymorphismes de dix systèmes de GSE, en étudiant 343 populations sur les 5 continents. Les fréquences alléliques et haplotypiques ont été confrontées, via des ajustements de modèles de régression, aux données d’environnements potentiellement agressifs et aux données culturelles. Une étude a aussi été réalisée plus en détail sur le système Duffy par des analyses de description et de détection de la sélection naturelle sur données SNP. Ces travaux de recherche s’intègrent tous dans une problématique appliquée en vue d’une amélioration de la sécurité transfusionnelle des populations.

Population genetics in anthropology, at the heart of a multidisciplinary approach, tries to discern what is natural or cultural selection, demography and settlement history, in the explanation of the current distribution of human genetic diversity. My Ph.D. work, in three parts, is based on the search for a better knowledge and understanding of the geographical distribution of red blood cell polymorphisms: the surface antigens defining the red cell blood group systems (BGS) and a cytoplasm polymorphism, the glucose 6-phosphate dehydrogenase (G6PD). The first part corresponds to the analysis, on 75 Eurasian populations, of frequencies of the DI*01 allele coding for the Diego a antigen of the Diego BGS, the C2-M217 and C2-M401 haplotypes of the Y chromosome, geographic coordinates and languages, and has shown a correlation between these different markers. The DI*01 allelic distribution seems to follow the Mongol conquests, carried by the Altaic-speaking nomads possessing the C2-M217 and C2-M401 haplotypes of the Y chromosome, with a radial expansion from Mongolia, which had not been demonstrated until then. Addressing health-environment relations, the second part studies the G6PD gene in 80 individuals from French Guiana of the Noir Marron community originating from sub-Saharan Africa. Characteristic mutations of sub-Saharan variants of G6PD deficiency have occurred in one in eight people. The G6PD deficiency distribution was previously unknown in French Guiana and is still poorly known in Latin America countries and the Caribbean, in most of which Plasmodium vivax still cracks down. Its treatment requires the use of primaquine which may cause severe haemolysis in G6PD-deficient individuals. In the last part, my objective was to confirm or highlight the influence of different environmental and cultural factors on the distribution of polymorphisms of 10 BGS, by studying 343 populations spread over the 5 continents. Allelic and haplotypic frequencies have been confronted, through regression model adjustments, to potentially aggressive environments and cultural data. A study has been also conducted in more detail on the Duffy BGS, by analyses of description and detection of natural selection on SNP data. All these Ph.D. works are part of an applied challenge in order to improve the transfusion safety of populations.