enseignant-chercheur, enseignant du supérieur*chercheur en milieu académique*chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*pilotage de la recherche et de linnovation, gestion de projets innovants, pilotage de structures innovantes*métiers daccompagnement et de support à la recherche, à linnovation et à la valorisation, au développement des Spin Off et Start-up innovantes*expertise, études et conseils dans des organisations, cabinets ou sociétés fournissant des prestations intellectuelles, des expertises scientifiques, prospectives ou stratégiques*entrepreneur des domaines innovants*
Coordonnées
leo.herault9338@gmail.com
Expérience professionelle
Domaine d'activité : Modélisation mathématiques et analyses de données biologiques
Type de contrat : CDD
Fonction exercée : Attaché temporaire d'enseignement et de recherche
Secteur d'emploi : Université, Etablissement d'enseignement supérieur
Organisme de rattachement ou entreprise :
Institut Mathématique de Marseille
Ville : Marseille
Pays : FRANCE
Adresse professionnelle
Techniques maîtrisées
Langage de script: Python,Bash
Langage de programmation: Java
Bioinformatique: Bowtie,STAR,Cufflinks,MACS,Samtools,Picard,Galaxy,IGV
Analyses statistiquesl R: Bioconductor, DESeq, normalisation, ACP, ANOVA, clustering, classification supervisée
Package R pour le single cell : Monocle, Scater, Seurat, Scenic
Informatique: Linux, Snakemake,Conda,Cytoscape,Latex,Eclipse,Rstudio,Git
Biologie moléculaire: extraction, séparation, quantification et purification dacides nucléiques et de protéines; (RT-q)PCR
Compétences
Pack office
Qualité: norme ISO 9001, NF X 50-900
Doctorat
Intitulé : Informatique
1ère inscription en thèse :
Octobre 2017 /
4A these 2020
École doctorale :
Mathématiques et Informatique de Marseille
Sujet :
Élucider le devenir de la cellule souche hématopoïétique par une approche de modélisation mathématique
Directeur de thèse :
Elisabeth REMY
Co-directeur :
Estelle DUPREZ
Unité de recherche :
I2M - Institut de Mathématiques de Marseille
Intitulé de l'équipe :
Master
Intitulé : BIOINFORMATIQUE, BIOCHIMIE STRUCTURALE ET GENOMIQUE
Octobre 2016 - Aix-Marseille Université
Mention : Bien
Langues vivantes
Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur
Français : Maternel
Production scientifique
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Characterization of mouse early hematopoiesis changes during aging with high throughput single-cell RNA-sequencing
Journée Ouverte Biologie Informatique Mathématique 2018
2018
Leonard Herault, Mathilde Poplineau, Nadine Platet, Elisabeth Remy, Estelle Duprez
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Nidogen-1 Contributes to the Interaction Network Involved in Pro-B Cell Retention in the Peri-sinusoidal Hematopoietic Stem Cell Niche.
Cell reports
2019
Marielle Balzano, Maria De Grandis, Thien-Phong Vu Manh, Lionel Chasson, Florence Bardin, Anne Farina, Arnauld Sergé, Ghislain Bidaut, Pierre Charbord, Léonard Hérault, Anne-Laure Bailly, Amandine Cartier-Michaud, Annie Boned, Marc Dalod, Estelle Duprez, Paul Genever, Mark Coles, Marc Bajenoff, Luc Xerri, Michel Aurrand-Lions, Claudine Schiff et Stéphane J.C. Mancini
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.02.065
-
PLZF limits enhancer activity during hematopoietic progenitor aging
Nucleic Acids Research
2019
Mathilde Poplineau, Julien Vernerey, Nadine Platet, Lia Nguyen, Léonard Hérault, Michela Esposito, Andrew J Saurin, Christel Guilouf, Atsushi Iwama, Estelle Duprez
https://doi.org/10.1093/nar/gkz174
-
The hematopoietic stem cell aging
2nd COURSE ON COMPUTATIONAL SYSTEMS BIOLOGY OF CANCER, Institut Curie, Paris, France
2019
Léonard Hérault, Adrien Mazuel, Mathilde Poplineau, Nadine Platet, Elisabeth Remy et Estelle Duprez
-
Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cell
bioRxiv
2020
Léonard Hérault, Mathilde Poplineau, Adrien Mazuel, Nadine Platet, Élisabeth Remy, Estelle Duprez
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.17.156893v1
