Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Surveillance,resistance bactérienne,MIDAS,Microbiologie,
Keywords
Epidemiological surveillance,Bacterial resistance,MIDAS,Microbiological,
Titre de thèse
Surveillance épidémiologique de la résistance bactérienne à partir des données de MIDAS(Méditerranée Infection datawarehousing and surveillance) dans la région Provence Alpes Côte d'Azur
Epidemiological surveillance of bacterial resistance from Méditerranée Infection datawarehousing and surveillance
Date
Friday 22 November 2019
Adresse
19-21 Boulevard Jean Moulin, 13005 Marseille Salle 1
Jury
Directeur de these |
M. Jean Marc ROLAIN |
MEPHI, Aix Marseille Université, IHU Méditerranée Infection, AP-HM, Marseille |
S 1076 « Physiopathologie de lendothélium » |
Laurence CAMOIN |
INSERM |
Rapporteur |
M. Max MAURIN |
Centre National de Référence des Francisella Laboratoire de Bactériologie CHU de Grenoble et des Alpes - Institut de biologie et de pathologie |
Rapporteur |
M. Jean Philippe LAVIGNE |
Centre National de Référence Brucellose - Laboratoire associé |
Résumé de la thèse
La résistance aux antibiotiques est un sujet dactualité qui intéresse autant le monde scientifique que les médias. Limpact de la résistance sur la prise en charge et la mortalité sont généralement estimés par des modèles prédictifs et non des modèles factuels. Ces modèles prédictifs permettent de réaliser des estimations mais celles-ci sont fausses et ne reflètent pas la réalité. Ainsi, lune des dernières grandes études publiées est celle de Cassini et al. qui estime le coût de la résistance aux antibiotiques en Europe à 33,000 morts par an. En outre selon le rapport de lOCDE, la résistance aux antibiotiques pourrait couter 3.5 milliards de dollars US par an.
Lobjectif de cette thèse dévaluer la prévalence de la résistance aux antibiotiques et dévaluer le coût humain de cette résistance en utilisant des données issues de systèmes de surveillance développés au sein de lInstitut Hospitalo-Universitaire de Marseille
Cette thèse a été divisé en trois objectifs : i) évaluer les capacités actuelles de récupération des données réelles par une revue de la littérature recensant les systèmes de surveillance de la résistance aux antibiotiques dans le monde afin de définir les besoins et les améliorations à réaliser de ces systèmes de surveillance ; ii) établir la prévalence de la résistance aux antibiotiques clés dans la région PACA et évaluer limpact sur la mortalité de cette résistance lors de sepsis à lAP-HM, iii) montrer lintérêt des systèmes de surveillance mis en place à lIHU et les améliorations réalisées pour mieux détecter des évènements anormaux concernant la résistance aux antibiotiques.
Thesis resume
Antibiotic resistance is a topical issue of interest to both the scientific community and the media. The impact of resistance on management and mortality is generally estimated by predictive models and not by factual models. These predictive models allow estimates to be made, but they are false and do not reflect reality. For example, one of the latest major studies published is that of Cassini et al., which estimates the cost of antibiotic resistance in Europe at 33,000 deaths per year. In addition, according to the OECD report, antibiotic resistance could cost US$3.5 billion per year.
The objective of this thesis is to evaluate the prevalence of antibiotic resistance and to evaluate the human cost of this resistance using data from surveillance systems developed at the Institut Hospitalo-Universitaire de Marseille.
This thesis has been divided into three objectives: i) assess current capacities for recovering actual data through a review of the literature identifying antibiotic resistance surveillance systems worldwide to define the needs and improvements to be made in these surveillance systems; ii) establish the prevalence of key antibiotic resistance in the PACA region and assess the impact on mortality of this resistance during AP-HM sepsis; iii) demonstrate the value of the surveillance systems put in place at the IHU and the improvements made to better detect abnormal events regarding antibiotic resistance.