Soutenance de thèse de SOURICE Mathieu

Résumé de la thèse

Les bactéries produisent de petites molécules, les métabolites secondaires, qui intéressent la recherche pour leurs nombreuses propriétés thérapeutiques et leur rôle au sein du biotope. Les myxobactéries sont des bactéries à Gram-négatif décrites comme des multi-producteurs de métabolites secondaires. Cependant, leur identification et production en laboratoire est complexe. Durant ma thèse, j'ai utilisé la myxobactérie, M. xanthus, pour développer une approche 2PRIM-BOOST, qui combine optimisation du protocole de culture de M. xanthus et biologie synthétique. Les avantages de cette approche sont une accumulation de composés intervenants dans la biosynthèse des métabolites secondaires, et l'obtention d'un métabolome épuré facilitant l'identification structurale et la mise en évidence d'activités biologiques. Comme preuve de concept, la combinaison des différents outils a permis d'augmenter très significativement la production de la myxoprincomide. Une fois validée, cette méthode m'a permis de découvrir un nouveau métabolite, et des analogues, qui restent à caractériser. Pour leur biosynthèse, certains métabolites nécessitent des protéines avec un cofacteur à centre Fe-S. J'ai étudié le processus de biogenèse des protéines Fe-S chez M. xanthus et découvert un contexte génétique dans lequel l'expression des machineries de biogenèse des centres Fe-S est maximale. L'ensemble de mes travaux serviront à identifier les métabolites secondaires inconnus de M. xanthus, et de façon plus large ceux des myxobactéries, qu'ils dépendent ou non de protéines Fe-S.