Soutenance de thèse de MERROUCHE Nor El Houda


Titre de thèse

Exploration des maladies infectieuses anciennes : Apport de la Paléosérologie et de la Paléoculture

Exploration of ancient infectious diseases: Contribution of paleoserology and paleoculture

Date

18 December 2025 à 10h00

Adresse

IHU Méditerranée Infection (19-21 boulevard Jean Moulin, 13005 Marseille, Salle 08

Ecole doctorale

Recherches Biomédicales

Specialité

RECHERCHES BIOMEDICALES Maladies infectieuses et microbiote

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots clés

Paléomicrobiologie,dents,tartre,pulpe dentaire,microbiote ancien,pathogènes

Keywords

Paleomicrobiology,teeth,Calculus,dental pulp,ancient microbiota,pathogens

Jury

Jury de thèse
Qualité Nom Etablissement
Professeure des universités - praticienne hospitalière Mme TERRER Elodie Aix-Marseille Université - AP-HM, MEPHI, IHU Méditerranée Infection,
Professeure des universités - praticienne hospitalière Mme FENOLLAR Florence Aix Marseille University - AP- HM- RITMES
Professeur des universités - praticien hospitalier M. MEURIC Vincent Université de Rennes 1, UFR Odontologie,
Professeure Mme GRIMAUD- HERVE Dominique Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)

Résumé de la thèse

Cette thèse, inscrite dans le domaine de la paléomicrobiologie, explore la détection de biomarqueurs et de micro-organismes anciens à partir de la pulpe et du tartre dentaire. Ces matrices biologiques offrent un accès privilégié à l'étude des maladies infectieuses historiques et de l'évolution des agents pathogènes.
Nos travaux ont démontré la faisabilité de la détection de protéines et de micro-organismes anciens, notamment des coronavirus, dans des restes humains du XIXᵉ siècle, fournissant les premières preuves sérologiques de leur circulation en France à cette époque. Parallèlement, la paléoculture s'est révélée une méthode complémentaire prometteuse pour l'isolement direct de microbes anciens.
Dans le cadre de nos investigations sur la présence éventuelle d'épidémies de grippe au XIXᵉ siècle, les analyses sérologiques du virus Influenza se sont révélées négatives, laissant supposer une absence d'épisode épidémique significatif avant la Grippe espagnole (1918–1919), première pandémie attestée par des preuves sérologiques et moléculaires. Dans son ensemble, ce travail met en évidence le potentiel du tartre et de la pulpe dentaires pour reconstituer le passé microbien de l'humanité et souligne la nécessité de poursuivre ces recherches afin de mieux comprendre l'émergence et l'évolution des agents infectieux au fil du temps.
Mots clés : Paléomicrobiologie, paléosérologie, maladies infectieuses, tartre dentaire, pulpe dentaire, protéines anciennes, coronavirus, influenza.


Thesis resume

This thesis, conducted within the field of paleomicrobiology, explores the detection of ancient biomarkers and microorganisms from dental pulp and calculus. These biological matrices provide privileged access to the study of historical infectious diseases and the evolutionary dynamics of pathogenic agents.
Our research demonstrated the feasibility of detecting ancient proteins and microorganisms, notably coronaviruses, in 19th-century human remains, providing the first serological evidence of their circulation in France during that period. In parallel, paleoculture proved to be a promising complementary approach for the direct isolation of ancient microbes.
As part of our investigations into the possible occurrence of influenza epidemics during the 19th century, serological analyses targeting the Influenza virus yielded negative results, suggesting the absence of any significant epidemic episode prior to the Spanish flu (1918–1919) — the first pandemic confirmed by both serological and molecular evidence.
Overall, this work highlights the potential of dental pulp and calculus as key matrices for reconstructing humanity's microbial past and emphasizes the need to further pursue such research to better understand the emergence and evolution of infectious agents throughout time.
Keywords : Paleomicrobiology, paleoserology, infectious diseases, dental calculus, dental pulp, ancient proteins, coronavirus, influenza.