Monsieur Maxime FUDUCHE / PhD

Techniques

Microbiologie : échantillonnage/culture (aérobiose, anaérobiose, « roll tubes »)/concentration/purification de bactéries magnétotactiques, observations au microscope optique, réalisation de grilles pour des observations en microscopie électronique. Techniques moléculaires : extraction d'ADN, techniques d'écologie moléculaire (DGGE, FISH), PCR, qPCR. Techniques d'analyses biochimiques : techniques d'électrophorèse, dosage de protéines, dosage du fer, dosage des sulfures. Techniques d'écologie marine : échantillonnage le long de transects (végétaux/téléostéens/macrofaune benthique/coraux), tri et identification à la loupe binoculaire d'espèces de la macrofaune benthique, dissections et biométrie (animaux, végétaux). Analyses de données : indices de diversité, analyse de la structure des communautés (abondance/régime trophique de la macrofaune benthique endogée), courbes granulométriques, matière organique, MDS, ACP, ANOSIM, regroupement statistique (clustering), étude de diversité microbienne, traitement d'images (Gimp v2.8). Bioinformatique : logiciels R., PRIMER v6.1.13, alignement de séquences nucléotidiques (BioEdit, BLAST), construction de dendrogrammes (méthode UPGMA, neighbor-joining), MEGA v5.1. Titulaire du Certificat Informatique et Internet (C2I) niveau 1.