Madame Nisrine CHELKHA / PhD

chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*

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Research : OUI

PhD

Title : Biologie-Santé - Spécialité Bioinformatique et Génomique

First registration date : 1 October 2016 / 3A

Doctoral school : Sciences de la Vie et de la Santé

Thesis defense date : 22 November 2019

Subject : Etude génomique des interactions entre les Acanthamoeba et les virus géants

Thesis supervisor : LEVASSEUR Anthony

Thesis co-supervisor : COLSON Philippe

Research unit : MEPHI - Microbes Evolution Phylogénie et Infections

Team : MEPHI - E4 - Culturomique clinique et environnementale et génomique des virus respiratoires

Master's degree

Title : Bioinformatique, biochimie structurale et génomique

September 2016 - AMU

Mention : Bien

Publications

  • Deciphering the genomes of 16 Acanthamoeba species does not provide evidence of integration of known giant virus-associated mobile genetic elements
    Virus Research, 2018
    Nisrine Chelkha, Philippe Colson, Anthony Levasseur, Bernard La Scola

  • Discovery and Further Studies on Giant Viruses at the IHU Mediterranee Infection That Modified the Perception of the Virosphere
    Viruses, 2019
    Clara Rolland, Julien Andreani, Amina Louazani, Sarah Aherfi, Rania Francis, Rodrigo Rodrigues, Ludmila Silva, Dehia Sahmi, Said Mougari, Nisrine Chelkha, Meriem Bekliz, Lorena Silva, Felipe Assis, Fabio Dornas, Jacques Khalil, Isabelle Pagnier, Christelle Desnues, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Jonatas Abrahao, Bernard Scola

  • Draft genome and description of Merdibacter massiliensis gen.nov., sp. nov., a new bacterium genus isolated from the human ileum
    Scientific Reports, 2019
    Hussein Anani, Rita Abou Abdallah, Nisrine Chelkha, Anthony Fontanini, Davide Ricaboni, Morgane Mailhe, Didier Raoult, Pierre-Edouard Fournier
    https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02158950/document
  • A Phylogenomic Study of Acanthamoeba polyphaga Draft Genome Sequences Suggests Genetic Exchanges With Giant Viruses
    Frontiers in Microbiology, 2018
    Nisrine Chelkha, Anthony Levasseur, Pierre Pontarotti, Didier Raoult, Bernard La Scola, Philippe Colson

Languages

Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur

Arabe : C2 - Maternel

Français : Maternel