Monsieur Léonard HERAULT / PhD


enseignant-chercheur, enseignant du supérieur*chercheur en milieu académique*chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*pilotage de la recherche et de l'innovation, gestion de projets innovants, pilotage de structures innovantes*métiers d'accompagnement et de support à la recherche, à l'innovation et à la valorisation, au développement des Spin Off et Start-up innovantes*expertise, études et conseils dans des organisations, cabinets ou sociétés fournissant des prestations intellectuelles, des expertises scientifiques, prospectives ou stratégiques*entrepreneur des domaines innovants*

Contact details

Professional contact details

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Professional experience

Field of activity : Modélisation mathématiques et analyses de données biologiques

Contract type : ATER

Function : Attaché temporaire d'enseignement et de recherche

Sector : Université, Etablissement d'enseignement supérieur

Organization or company : Institut Mathématique de Marseille

Company size : 100-499

City : Marseille

Country : FRANCE

Jobs

Additional information : Musique: clarinette 9 années d'études aux conservatoire de Grenoble (3ème cycle) Sport: Handball, ski, tennis

Research : NON

Skills

Pack office Qualité: norme ISO 9001, NF X 50-900

Techniques

Langage de script: Python,Bash Langage de programmation: Java,ASP Bioinformatique: Bowtie,STAR,Cufflinks,MACS,Samtools,Picard,Galaxy,IGV Analyses statistiquesl R: Bioconductor, DESeq, normalisation, ACP, ANOVA, clustering, classification supervisée Package R pour le single cell : Monocle, Scater, Seurat, Scenic Informatique: Linux, Snakemake,Conda,Cytoscape,Latex,Eclipse,Rstudio,Git Biologie moléculaire: extraction, séparation, quantification et purification d'acides nucléiques et de protéines; (RT-q)PCR

PhD

Title : Informatique

First registration date : 2 October 2017 / 4A

Doctoral school : Mathématiques et Informatique de Marseille

Thesis defense date : 17 September 2021

Subject : Etude du vieillissement des cellules souches hématooïétiques par la biologie des systèmes: Séquençage d'ARN et réseau booléen de régulations génétiques à l'échelle de la cellule unique

Thesis supervisor : REMY Elisabeth

Thesis co-supervisor : DUPREZ Estelle

Research unit : I2M - Institut de Mathématiques de Marseille

Master's degree

Title : BIOINFORMATIQUE, BIOCHIMIE STRUCTURALE ET GENOMIQUE

October 2016 - Aix-Marseille Université

Mention : Bien

Publications

  • Characterization of mouse early hematopoiesis changes during aging with high throughput single-cell RNA-sequencing
    Journée Ouverte Biologie Informatique Mathématique 2018, 2018
    Leonard Herault, Mathilde Poplineau, Nadine Platet, Elisabeth Remy, Estelle Duprez

  • Nidogen-1 Contributes to the Interaction Network Involved in Pro-B Cell Retention in the Peri-sinusoidal Hematopoietic Stem Cell Niche.
    Cell reports, 2019
    Marielle Balzano, Maria De Grandis, Thien-Phong Vu Manh, Lionel Chasson, Florence Bardin, Anne Farina, Arnauld Sergé, Ghislain Bidaut, Pierre Charbord, Léonard Hérault, Anne-Laure Bailly, Amandine Cartier-Michaud, Annie Boned, Marc Dalod, Estelle Duprez, Paul Genever, Mark Coles, Marc Bajenoff, Luc Xerri, Michel Aurrand-Lions, Claudine Schiff et Stéphane J.C. Mancini
    https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.02.065
  • PLZF limits enhancer activity during hematopoietic progenitor aging
    Nucleic Acids Research, 2019
    Mathilde Poplineau, Julien Vernerey, Nadine Platet, Lia N'guyen, Léonard Hérault, Michela Esposito, Andrew J Saurin, Christel Guilouf, Atsushi Iwama, Estelle Duprez
    https://doi.org/10.1093/nar/gkz174
  • The hematopoietic stem cell aging
    2nd COURSE ON COMPUTATIONAL SYSTEMS BIOLOGY OF CANCER, Institut Curie, Paris, France, 2019
    Léonard Hérault, Adrien Mazuel, Mathilde Poplineau, Nadine Platet, Elisabeth Remy et Estelle Duprez

  • Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
    bioRxiv, 2021
    Léonard Hérault, Mathilde Poplineau, Adrien Mazuel, Nadine Platet, Élisabeth Remy, Estelle Duprez
    https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-00955-z

Languages

Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur

Français : Maternel