Monsieur Léonard HERAULT / PhD
enseignant-chercheur, enseignant du supérieur*chercheur en milieu académique*chercheur en entreprise, R&D du secteur privé*pilotage de la recherche et de l'innovation, gestion de projets innovants, pilotage de structures innovantes*métiers d'accompagnement et de support à la recherche, à l'innovation et à la valorisation, au développement des Spin Off et Start-up innovantes*expertise, études et conseils dans des organisations, cabinets ou sociétés fournissant des prestations intellectuelles, des expertises scientifiques, prospectives ou stratégiques*entrepreneur des domaines innovants*
Contact details
Professional contact details
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Professional experience
Field of activity : Modélisation mathématiques et analyses de données biologiques
Contract type : ATER
Function : Attaché temporaire d'enseignement et de recherche
Sector : Université, Etablissement d'enseignement supérieur
Organization or company : Institut Mathématique de Marseille
Company size : 100-499
City : Marseille
Country : FRANCE
Jobs
Additional information : Musique: clarinette 9 années d'études aux conservatoire de Grenoble (3ème cycle) Sport: Handball, ski, tennis
Research : NON
Skills
Pack office Qualité: norme ISO 9001, NF X 50-900
Techniques
Langage de script: Python,Bash Langage de programmation: Java,ASP Bioinformatique: Bowtie,STAR,Cufflinks,MACS,Samtools,Picard,Galaxy,IGV Analyses statistiquesl R: Bioconductor, DESeq, normalisation, ACP, ANOVA, clustering, classification supervisée Package R pour le single cell : Monocle, Scater, Seurat, Scenic Informatique: Linux, Snakemake,Conda,Cytoscape,Latex,Eclipse,Rstudio,Git Biologie moléculaire: extraction, séparation, quantification et purification d'acides nucléiques et de protéines; (RT-q)PCR
PhD
Title : Informatique
First registration date : 2 October 2017 / 4A
Doctoral school : Mathématiques et Informatique de Marseille
Thesis defense date : 17 September 2021
Subject : Etude du vieillissement des cellules souches hématooïétiques par la biologie des systèmes: Séquençage d'ARN et réseau booléen de régulations génétiques à l'échelle de la cellule unique
Thesis supervisor : REMY Elisabeth
Thesis co-supervisor : DUPREZ Estelle
Research unit : I2M - Institut de Mathématiques de Marseille
Master's degree
Title : BIOINFORMATIQUE, BIOCHIMIE STRUCTURALE ET GENOMIQUE
October 2016 - Aix-Marseille Université
Mention : Bien
Publications
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Characterization of mouse early hematopoiesis changes during aging with high throughput single-cell RNA-sequencing
Journée Ouverte Biologie Informatique Mathématique 2018, 2018
Leonard Herault, Mathilde Poplineau, Nadine Platet, Elisabeth Remy, Estelle Duprez
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Nidogen-1 Contributes to the Interaction Network Involved in Pro-B Cell Retention in the Peri-sinusoidal Hematopoietic Stem Cell Niche.
Cell reports, 2019
Marielle Balzano, Maria De Grandis, Thien-Phong Vu Manh, Lionel Chasson, Florence Bardin, Anne Farina, Arnauld Sergé, Ghislain Bidaut, Pierre Charbord, Léonard Hérault, Anne-Laure Bailly, Amandine Cartier-Michaud, Annie Boned, Marc Dalod, Estelle Duprez, Paul Genever, Mark Coles, Marc Bajenoff, Luc Xerri, Michel Aurrand-Lions, Claudine Schiff et Stéphane J.C. Mancini
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.02.065
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PLZF limits enhancer activity during hematopoietic progenitor aging
Nucleic Acids Research, 2019
Mathilde Poplineau, Julien Vernerey, Nadine Platet, Lia N'guyen, Léonard Hérault, Michela Esposito, Andrew J Saurin, Christel Guilouf, Atsushi Iwama, Estelle Duprez
https://doi.org/10.1093/nar/gkz174
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The hematopoietic stem cell aging
2nd COURSE ON COMPUTATIONAL SYSTEMS BIOLOGY OF CANCER, Institut Curie, Paris, France, 2019
Léonard Hérault, Adrien Mazuel, Mathilde Poplineau, Nadine Platet, Elisabeth Remy et Estelle Duprez
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Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
bioRxiv, 2021
Léonard Hérault, Mathilde Poplineau, Adrien Mazuel, Nadine Platet, Élisabeth Remy, Estelle Duprez
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-00955-z
Languages
Anglais : B2 - Intermédiaire supérieur
Français : Maternel