Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé: Biochimie structurale
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
Structure,VIRULENCE,cryo-em,bacteroides fragilis,cancer,microbiologie
Keywords
structural,VIRULENCE,cryo-em,bacteroides fragilis,cancer,microbiology
Titre de thèse
Caractérisation biochimique et structurale du complexe membranaire unique dans le Système de Sécrétion de Type VI des Bacteroidota
Biochemical and structural characterization of the unique membrane complex in the Bacteroidota Type VI Secretion System
Date
Lundi 2 Décembre 2024 à 13:00
Adresse
31 Chemin Joseph Aiguiller 13009 Marseille, Amphithéatre des thèses Pierre Desnuelle Pierre Desnuelle
Jury
Directeur de these |
M. Eric DURAND |
LCB (CNRS) - INSERM |
Examinateur |
Mme Juan REGUERA |
AFMB (CNRS) - INSERM |
Examinateur |
Mme Petya KRASTEVA |
IECB - CNRS |
Rapporteur |
Mme Isabelle SCHALK |
CNRS - BSC Strasbourg |
Rapporteur |
Mme Nadia IZADI-PRUNEYRE |
CNRS - Institut Pasteur |
Examinateur |
M. Antoine TALY |
IECB - LBT - CNRS |
Président |
M. Romé VOULHOUX |
CNRS - LCB |
Résumé de la thèse
Le Système de Sécrétion de Type VI (T6SS) est une nanomachine presente chez 25% des bacteries didermes. Sa fonction est dinjecter dans les cellules adjacentes une toxine, dans un but de compétiton bactérienne. Bacteroides fragilis est une bactérie diderme du tractus digestif humain jouant plusieurs roles, tel que la dégradation des glucides ou limmunomodulation. Sa présence peut cependant être un probleme de santé majeur a cause notamment dune toxine, BFT. La présence de cette toxine chez une souche de B. fragilis la classe dans la catégorie des EnteroToxigenic Bacteroides Fragilis (ETBF). La présence de ETBF dans le tractus digestif est hautement corrélé au développement du cancer du colon et de scepticémies. Le cancer du colon est le troisième cancer le plus répandu et le deuxieme cancer le plus meurtrier, après le cancer des poumons. On compte près de 2 millions de nouveaux cas en 2020 et près d1 million de décès. Le T6SS présent chez B. fragilis est encore peu étudié, il reprends les composants classiques retrouvés chez le T6SS des Protéobactéries, mais les genes codant pour son complexe membranaire, un élément clé du T6SS, sont absents de son génome. Mon projet de thèse vise a la caractérisation des 5 protéines codées par les genes présents dans le locus de fonction inconnue jusquà lors : tssNQOPR.
Thesis resume
The Type VI Secretion System (T6SS) is a nanomachine present in 25% of diderm bacteria. Its function is to inject a toxin into adjacent cells for bacterial competition. Bacteroides fragilis is a diderm bacterium of the human digestive tract playing several roles, such as the degradation of carbohydrates or immunomodulation. However, its presence can be a major health problem due to a toxin, BFT. The presence of this toxin in a strain of B. fragilis classifies it in the category of EnteroToxigenic Bacteroides Fragilis (ETBF). The presence of ETBF in the digestive tract is highly correlated with the development of colon cancer and septicemia. Colon cancer is the third most common cancer and the second most deadly cancer, after lung cancer. There were nearly 2 million new cases in 2020 and nearly 1 million deaths. The T6SS present in B. fragilis is still poorly studied; it includes the classic components found in the T6SS of Proteobacteria, but the genes coding for its membrane complex, a key element of the T6SS, are absent from its genome. My thesis project aims to characterize the 5 proteins encoded by the genes present in the locus of previously unknown function : tssNQOPR.