Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

POUX,ARTHROPODE,MALDI TOF MS,EPIDEMIOLOGIE,

Keywords

LICE,ARTHROPODE,MALDI TOF MS,EPIDEMIOLOGY,

Titre de thèse

DEVELOPPEMENT D'OUTILS INNOVANTS POUR L'IDENTIFICATION ET LA CLASSIFICATION DES ARTHROPODES
DEVELOPMENT OF INNOVATIVE TOOLS FOR THE IDENTIFICATION AND CLASSIFICATION OF ARTHROPODS

Date

Jeudi 1 Juillet 2021 à 15:00

Adresse

19-21 Boulevard Jean Moulin, 13005 Marseille Salle 1

Jury

Directeur de these M. Philippe PAROLA IHU Méditerranée Infection
Rapporteur M. Pascal DELAUNAY Service de Parasitologie-Mycologie CHU de Nice - Hôpital de l'Archet
Examinateur M. Arezki IZRI Parasitologie-Mycologie AP-HP, HUPSSD, Hôpital Avicenne, Université Paris 13/ UMR 190, Unité des virus émergents, Université Aix-Marseille
Rapporteur Mme Christelle POMARES Centre Hospitalier Universitaire de Nice Laboratoire de Parasitologie-MycologieUniversité de Nice-Sophia Antipolis, Inserm U 1065 Hôpital de l'ARCHET

Résumé de la thèse

L’entomologie médicale et vétérinaire est une discipline scientifique qui s’intéresse à l’étude des insectes et des arthropodes d’importance médicale. Les arthropodes tels que les poux, les tiques et les puces ont une grande importance en santé humaine et animale de part leur compétence vectorielle, à cet effet, une bonne lutte anti-vectorielle ainsi qu’une bonne surveillance épidémiologique des vecteurs demeurent dès éléments clés dans les stratégies de lutte et de contrôle des maladies vectorielles d’où la nécessité d’une identification précise des arthropodes vecteurs et un bon suivi moléculaire des microorganismes associés. Nos travaux de thèse ont porté dans le premier volet et dans un premier temps sur l’identification des arthropodes en faisant recours à plusieurs méthodes d’identification à savoir (Identification morphologique, moléculaire et essentiellement la spectrométrie de masse MALDI-TOF ). En second lieu, nous nous sommes penchés sur l’étude des microorganismes associés aux arthropodes (poux, tique et puces) et/ou leurs hôtes. Ainsi, au cours de nos investigations, nous avons pu après une identification morphologique et moléculaire, identifier des poux humains d’élevage et des poux d’animaux conservé à -20°C en provenance de France et plusieurs régions d’Algérie par le biais de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS, ainsi que des poux conservés dans l’alcool à 70%. La recherche par la suite des microorganismes associés aux poux par les outils de biologie moléculaire (qPCR, PCR standard et la phylogénie) a permis de révéler le portage de plusieurs bactéries. Dans le deuxième volet de cette thèse, on s’est intéressé à la détection des microorganismes chez des petits mammifères (rongeurs) et leurs ectoparasites associés (Tiques molles) au Sénégal, ainsi que sur des tiques dures collectées sur les végétations en Slovaquie et enfin des puces d’hérisson collectées sur des patients originaires de Strasbourg. Les résultats des travaux de cette thèse ont confirmé pour la première fois l’efficacité et la précision du MALDI-TOF MS a identifié correctement et rapidement plusieurs espèces de poux quel que soit leurs modes de conservation (congélation ou alcool). Aussi cette étude a contribué à enrichir et compléter le répertoire des microorganismes chez plusieurs arthropodes (poux, tiques et puces) provenant de plusieurs régions Algérie, Sénégal, Slovaquie et Strasbourg. Ces différents travaux entrepris dans le cadre de cette thèse rapportent à cet effet plus d’informations relatives à l’utilité des différents outils d’identification quant au contrôle de l’épidémio-surveillance des maladies vectorielles.

Thesis resume

Medical and veterinary entomology is a scientific discipline concerned with the study of insects and arthropods of medical importance. Arthropods such as lice, ticks and fleas are of great importance in human and animal health due to their vectorial competence, for this purpose, good vector control and epidemiological surveillance of vectors remain key elements in vector-borne disease control strategies, hence the need for accurate identification of arthropod vectors and good molecular monitoring of associated microorganisms. Our thesis work focused in the first part and initially on the identification of arthropods by using several methods of identification (morphological identification, molecular and essentially the mass spectrometry MALDI-TOF). Secondly, we focused on the study of microorganisms associated with arthropods (lice, ticks and fleas) and/or their hosts. Thus, during our investigations, we were able after a morphological and molecular identification, to identify farmed human lice and animal lice stored at -20°C from France and several regions of Algeria through MALDI-TOF mass spectrometry, as well as lice stored in 70% alcohol. The subsequent search for lice-associated microorganisms using molecular biology tools (qPCR, standard PCR and phylogeny) revealed the carriage of several bacteria. In the second part of this thesis, we were interested in the detection of microorganisms in small mammals (rodents) and their associated ectoparasites (Soft ticks) in Senegal, as well as on hard ticks collected on vegetations in Slovakia and finally on hedgehog fleas collected on patients from Strasbourg. The results of this thesis confirmed for the first time the efficiency and accuracy of MALDI-TOF MS to correctly and rapidly identify several species of lice regardless of their preservation modes (freezing or alcohol). Also this study contributed to enrich and complete the repertoire of microorganisms in several arthropods (lice, ticks and fleas) from several regions Algeria, Senegal, Slovakia and Strasbourg. These different works undertaken within the framework of this thesis report to this effect more information relating to the utility of the various tools of identification as for the control of the epidemio-surveillance of the vectorial diseases.