Ecole Doctorale
Sciences de la Vie et de la Santé
Spécialité
Biologie-Santé - Spécialité Microbiologie
Etablissement
Aix-Marseille Université
Mots Clés
cuivre,bactérie,protéines chaperons,résistance,complexes de cuivre,
Keywords
copper,bacteria,chaperone protein,resistance,copper complexes,
Titre de thèse
Stress cuivre, impact sur l'homéostasie des protéines et rôle des protéines chaperons chez Escherichia coli.
Copper stress, impact on protein homeostasis and role of molecular chaperones in Escherichia coli
Date
Mercredi 7 Juin 2023 à 14:00
Adresse
31 chemin Joseph Aiguier 13009 Marseille AMPHI DESNUELLES
Jury
Directeur de these |
Mme MARIANNE ILBERT |
CNRS - IMM FR3479 |
Rapporteur |
Mme CARMEN GARRIDO |
INSERM U866 - FACULTÉ DE MÉDECINE |
Rapporteur |
M. SOUFIAN OUCHANE |
I2BC - PARIS SACLAY |
Examinateur |
Mme AGNÈS RODRIGUE |
INSA LYON |
Président |
M. PASCAL ARNOUX |
CEA CADARACHE |
Résumé de la thèse
Le cuivre est un ion métallique essentiel, participant à de nombreux processus cellulaires. Néanmoins, si sa concentration intracellulaire nest pas régulée, le cuivre devient alors toxique. Cette toxicité est mise à profit dans de nombreux domaines biotechnologiques et médicaux. Les mécanismes cellulaires de toxicité du cuivre chez Escherichia coli reposeraient sur sa capacité à participer à la réaction de Fenton générant des espèces réactives de loxygène (ROS) et à impacter les clusters Fe-S par mis-métallation. Lors de mes travaux de thèse, jai pu démontrer que le cuivre induit également lagrégation des protéines par un processus indépendant des ROS. En conduisant des expériences en condition aérobie et anaérobie, nous avons prouvé quen absence doxygène, le cuivre saccumulait dans les cellules, probablement sous sa forme Cu+, ou complexé au GSH, et entraînait lagrégation massive des protéines in vivo. Cette augmentation de protéines agrégées perturbe lhoméostasie des protéines, plus communément appelée protéostasie. Dans la continuité de ces travaux, limplication de chaperons moléculaires tels que DnaK et le Trigger Factor, dans la survie dE. coli en présence dun excès de cuivre a été démontrée. Ce résultat confirme limpact du cuivre sur la protéostasie, phénomène qui expliquerait la forte toxicité du cuivre en anaérobie. Mes travaux mettent également en évidence des stratégies de défenses bactériennes mises en place pour permettre la survie bactérienne.
Dautre part, ces travaux sur le cuivre ont été élargis aux complexes de cuivre, qui apparaissent comme de puissants agents antibactériens. Ces derniers sont composés dun ligand, tel que le Dp44mT ou le GTSM, qui en liant les ions Cu2+, forment les complexes Dp44mT:Cu2+ et GTSM :Cu2+. Jai pu démontrer que ces complexes étaient actifs à des doses largement inférieures aux doses utilisées pour le Cu seul. Leur mécanisme daction reposerait principalement sur leur capacité à traverser les barrières membranaires et à agir comme ionophores, le cuivre étant libéré dans le cytoplasme bactérien par compétition avec les composants intracellulaires. Nos travaux nont pas permis dobserver dactivité redox in vivo de ces composés dans les conditions testées. Ils ont fourni une meilleure compréhension des mécanismes de toxicité de ces composés. Les complexes de cuivre ouvrent des perspectives thérapeutiques à long terme mais qui nécessitent une meilleure compréhension de leur mécanisme daction afin de pouvoir optimiser leur fonctionnement et améliorer leur spécificité daction.
Thesis resume
Copper is an essential metal ion, involved in various cellular processes. However, if the intracellular copper concentration is not tightly controlled, copper can rapidly become toxic. This toxicity is exploited in many biotechnological and medical fields. The cellular mechanisms of copper toxicity in Escherichia coli are explained by its ability to participate to the Fenton reaction, generating reactive oxygen species (ROS) and to impact Fe-S clusters by mis-metalation. During my thesis, I was able to show that copper also induces protein aggregation in a ROS-independent manner. By setting experiments in aerobic and anaerobic conditions, we proved that in absence of oxygen, copper accumulates in the cells, probably in its Cu+ form, or complexed with GSH, and leads to massive protein aggregation in vivo. This copper increase disrupts protein homeostasis, more commonly known as proteostasis. We further demonstrated the implication of molecular chaperones such as DnaK and Trigger Factor, in the survival of E. coli in the presence of copper excess. This result confirms the impact of copper on proteostasis, a phenomenon that would explain the high toxicity of copper under anaerobic conditions. My work provided a better understanding of the mechanisms of copper toxicity and the bacterial defense strategies put in place against copper damages.
Afterwards, my work on copper has been extended to copper complexes, which appear to be powerful antibacterial agents. Copper complexes such as Dp44mT:Cu2+ and GTSM:Cu2+ complexes corresponds to a ligand, Dp44mT or GTSM, and their binding to Cu2+ ions. I showed that these complexes were efficient to prevent E. coli growth at lower doses than copper sulfate. Their mechanism of action is mainly explained by their ability to cross membrane barriers and to act as ionophores, copper is released into the bacterial cytoplasm and interferes with intracellular pathways. Our work did not allow us to observe any in vivo redox activity of these compounds under the conditions tested. Copper complexes open-up long-term therapeutic prospects, but they require a better understanding of their mechanism of action in order to optimize their impact and to improve their specificity of action.