Ecole Doctorale

Sciences de la Vie et de la Santé

Spécialité

Biologie-Santé - Spécialité Recherche Clinique et Santé Publique

Etablissement

Aix-Marseille Université

Mots Clés

EPIDEMIOLOGIE,SYNDROMIQUE,GABON,,

Keywords

EPIDEMIOLIGY,SYNDROMIC,GABON,,

Titre de thèse

MISE EN PLACE D UN SYSTEME DE SURVEILLANCE SYNDROMIQUE DES MALADIES INFECTIEUSES À POTENTIEL ÉPIDÉMIQUE AU GABON
SETTING UP OF A SYNDROMIC SURVEILLANCE SYSTEM OF INFECTIOUS DISEASES IN GABON

Date

Tuesday 26 June 2018 à 14:00

Adresse

Faculté de Médecine, 27 Boulevard Jean Moulin, 13385 Marseille cedex 5 Salle de thèse N°2

Jury

Directeur de these M. XAVIER DEPARIS Aix-Marseille Université
Rapporteur M. Jean Paul BOUTIN Ministère de la défense
Examinateur Mme Florence FENOLLAR Aix-Marseille Université
Examinateur M. Jean-Baptiste MEYNARD Aix-Marseille Université
CoDirecteur de these M. Jean-Bernard LÉKANA-DOUKI Faculté de Médecine, Université des Sciences de la Santé, B.P, 4009, Libreville, Gabon
Rapporteur M. Rémy MICHEL Ecole de santé des armées de Lyon-Bron

Résumé de la thèse

Les maladies infectieuses sont causées par des microorganismes pathogènes. Elles demeurent l'une des causes majeures de décès dans le monde, malgré les avancées considérables réalisées dans le domaine de la biologie médicale. Ainsi, il est important de mettre en place des stratégies qui nous permettrons de mieux détecter puis enrailler les épidémies nouvelles de maladies infectieuses émergentes ou réémergentes. Au Gabon, on estime que plus de la moitié des données disponibles ne sont pas collectées, et que plus de la moitié des données potentiellement collectées ne sont pas transmises au niveau central expliquant ainsi la lenteur à la réactivité du système de santé. Dans ce contexte, le développement d’un système de surveillance syndromique est l'une des solutions les plus efficaces pour y remédier. Ainsi en collaborant avec les différents professionnels de la santé (médecins et infirmiers), nous avons pu mettre en place un réseau de surveillance syndromique des maladies infectieuses à potentiel épidémique (SuSyMIPE) dans quatre sites (Gamba, Koulamoutou, Libreville et Oyem) sentinelles. Pour chaque syndrome, un groupe de maladies était évoqué. Les diagnostics syndromiques ont fait l'objet d'un codage, de façon quasi exhaustive et en temps réel. Chaque médecin responsable de site sentinelle transmettait journalièrement les notifications de cas codifiées par Short Message Service (SMS) en fin d'après-midi. Le recueil de données a été fait selon le schéma. Ce réseau qui est le seul système d’évaluation en temps quasi-réel d’une situation sanitaire, nous a permis d’enregistrer entre janvier et octobre 2016, 5348 cas suspects des syndromes surveillés, 28,1% (n = 1502) provenant de Koulamoutou 24,5% (n = 1310) de Libreville, 24% (n = 1284) Gamba et 23,4% (n = 1252) d'Oyem. Ces cas étaient répartis comme suit: 71,3% (n = 3816) des cas étaient des fièvres, 19,7% (n = 1053) des syndromes respiratoires et les cas des syndromes diarrhéiques représentaient 9% (n = 479). De plus la mise en place de ce réseau nous permis de détecter assez précocement l'épidémique de rougeole dans deux chefs-lieux de provinces (Libreville et Oyem) en 2016. Au total, entre les semaines 13 et 19, 79 cas suspects ont été notifiés, principalement 82,3% (n = 65) à Oyem et 17,7% (n = 14) à Libreville. Le sex-ratio M / F était de 0,88 (37/42), et l'âge moyen était de 49,37 ± 72.82 mois Parmi ceux-ci, 53,1% (n = 42) des femmes. Cependant, seulement environ 53,3% (n = 16/30) des cas testés biologiquement ont été confirmés avec la collaboration du centre de référence de l’OMS pour la rougeole. Ainsi, un déclenchement rapide de la riposte a été mise en place et l'épidémie enraillée en huit semaines. La mise en place de ce système de surveillance syndromique nous a permis de répondre de manière plus rapide et plus efficiente aux épisodes de rougeoles qui se sont manifestés. Il est donc urgent d’étendre ce réseau sur tout le territoire national.

Thesis resume

Infectious diseases are verified by pathogenic microorganisms. They keep one of the leading causes of death in the world, despite advances in the field of medical biology. Thus, it is important to put in place strategies that will allow us to better detect new epidemics of emerging or re-emerging infectious diseases. In Gabon, it is estimated that more than half of the available data are not collected, and that more than half of the data collected is not transmitted at the explicit central level as well as the slowness of the responsiveness of the health system. In this context, the development of a syndromic surveillance system is one of the most effective solutions to this problem. Thus, by collaborating with the various health professionals, we set up a surveillance network of infectious diseases with epidemic potential (SuSyMIPE) in four sites (Gamba, Koulamoutou, Libreville and Oyem) sentinels. For each syndrome, a group of diseases was mentioned. Syndromic diagnoses have been coded almost completely and in real time. Each sentinel site physician sent out coded case notifications by Short Message Service (SMS) on a daily basis in the late afternoon. The data collection was done according to the diagram. This network, which is the only real-time evaluation system for a health situation, enabled us to record between January and October 2016, 5348 suspected cases of the syndromes under surveillance, 28.1% (n = 1502) from of Koulamoutou 24.5% (n = 1310) from Libreville, 24% (n = 1284) Gamba and 23.4% (n = 1252) from Oyem. These cases were distributed as follows: 71.3% (n = 3816) of the cases were fevers, 19.7% (n = 1053) of the respiratory syndromes and the cases of diarrheal syndromes accounted for 9% (n = 479). In addition, the establishment of this network enabled us to detect the measles epidemic early in two provincial capitals (Libreville and Oyem) in 2016. In total, between weeks 13 and 19, 79 suspected cases were reported. reported, mainly 82.3% (n = 65) in Oyem and 17.7% (n = 14) in Libreville. The sex ratio M / F was 0.88 (37/42), and the mean age was 49.37 ± 72.82 months Among them, 53.1% (n = 42) of women. However, only about 53.3% (n = 16/30) of the biologically tested cases were confirmed with the collaboration of the WHO Reference Center for Measles. Thus, a rapid outbreak of the response was put in place and the epidemic rushed in eight weeks. The implementation of this syndromic surveillance system allowed us to respond more quickly and more efficiently to the episodes of measles that occurred. It is therefore urgent to extend this network throughout the national territory.